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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000011`

染色体: Chr08 坐标: 104417-106742 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000011`
名称	SmilChr08G000011
描述	aquaporin SIP1-1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	104417 - 106742 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999636`
GeneID	`130999636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999636`
原始查询	`LOC130999636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin SIP1-1
产物	aquaporin SIP1-1
Arabidopsis	`AT3G04090` (SIP1A) small and basic intrinsic protein 1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819564] identity=53.3; qcov=0.954; evalue=6.51e-68; confidence=high
Rice	`Os01g0182200` (OsSIP1) - identity=66.2; qcov=0.9; evalue=4.1e-88; confidence=high
GO	GO:0015250 (water channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057781213.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057781213.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781213.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781213.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:104648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B31
`Chr8:106074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr8:106135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B85
`Chr8:106394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:106414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:106631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:106643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B8,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781213.1

240 aa

120

240

MIP

PF00230 MIP 5-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781213.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	5	227	4.9e-18	66.5	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925230.1
GTGTGATTTTGATACATAGAAATATACACACCCAACTCTTCTTCCTCAAATCAATTCATCCGTCGCGATGGTTGCTGCCGTCATCAAGGCCGCCGTCGCCGATGCCGCACTCACCTTTATGTGGATTTTCTGCGCCTCCTCGCTCGGCGCTGTCACCTTCGTCGTCGCCTCAGCTCTCGGCGTCGCCCCCGGCCTGCCCTCCCTTTTTATCACCACTTTCCTCATCTTTATACTATTGTTCGTTTTCGGCTTCATCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999636
ATGGTTGCTGCCGTCATCAAGGCCGCCGTCGCCGATGCCGCACTCACCTTTATGTGGATTTTCTGCGCCTCCTCGCTCGGCGCTGTCACCTTCGTCGTCGCCTCAGCTCTCGGCGTCGCCCCCGGCCTGCCCTCCCTTTTTATCACCACTTTCCTCATCTTTATACTATTGTTCGTTTTCGGCTTCATCGGCGATCTCCTCGGCGGCGCCTCCTTCAATCCCACCGGCACTGCCGCCTTTTACGCGGCTGGCCTCGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781213.1
MVAAVIKAAVADAALTFMWIFCASSLGAVTFVVASALGVAPGLPSLFITTFLIFILLFVFGFIGDLLGGASFNPTGTAAFYAAGLGGADSLISAAVRFPAQAAGAVGGAVAIVEVMPVQYKHMLGGPSLKVDTNTGAIAEGVLTFVISLAVLFIIIKGPRSMILKNWMLAMSTVSLVVAGSSYTGPSMNPANAFGWAYVNNTHDTWEHFLVYWISPFIGAILAAWVFRFLCPPPPKEKKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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