当前解析结果
SmilChr08G000030| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000030 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000030 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000030 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 192477 - 235023 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999659 |
|---|---|
| GeneID | 130999659 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999659 |
| 原始查询 | LOC130999659 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999659 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057781239.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057781239.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057781239.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057781239.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057781239.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:192667 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A4,B110,B39,B50,C22,C49 |
Chr8:192669 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A4,B110,B39,B50,C22,C49 |
Chr8:192683 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A4,B110,B39,B50,C22,C49 |
Chr8:192750 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B110,C22 |
Chr8:192750 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B110,C22 |
Chr8:192814 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C16,C21,C33,C44,C61 |
Chr8:192859 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B50,C50,C70 |
Chr8:192890 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B32,C22,C63 |
Chr8:193456 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B68 |
Chr8:193486 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B43,C1 |
Chr8:193498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr8:193509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B42,B91 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。