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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000033`

染色体: Chr08 坐标: 236778-240106 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000033`
名称	SmilChr08G000033
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	236778 - 240106 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999660`
GeneID	`130999660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999660`
原始查询	`LOC130999660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=34.4; qcov=1.02; evalue=6.99e-136; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.1; qcov=1.03; evalue=4.25e-74; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781242.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781242.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781242.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781242.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:236988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C44
`Chr8:236994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B53,C42
`Chr8:237004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,B82,C48
`Chr8:237025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:237032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B95,C17
`Chr8:237063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B66,B76,C59
`Chr8:237092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:237153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B4,C1,C44
`Chr8:237157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B4,C1,C44
`Chr8:237192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:237196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B46,C15
`Chr8:237202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A6,B3,B8,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781242.1

927 aa

464

927

Rx_N

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-87 aa PF00931 NB-ARC 175-343 aa PF13401 AAA_22 190-282 aa PF23559 WHD_DRP 429-506 aa PF23598 LRR_14 580-877 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781242.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	87	6.3e-17	62.2	Rx N-terminal domain
`XP_057781242.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	343	4.3e-39	134.6	NB-ARC domain
`XP_057781242.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	190	282	4.5e-08	34.2	AAA domain
`XP_057781242.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	429	506	1.1e-11	45.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781242.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	580	877	1.2e-23	84.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925259.1
TAATTTACTTCCTTCTCATCACTAGCAAATCAAGAGTGTTCCACCAATCAATTAGACCAAAGATATCTGAGTCTCACCTCGAATTGTTGCAATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGATGGCTCTAGAAACCTTGCGCGATTTGTTGTTGGAAGAAGCAAGGTTTCTATCTGGTGTGGGCGATGAAGTGAGGGAGCTCGAGATCCAGCTGAAACAGATGAAGTGTCTCCTCGAAGATGCTGACAGAAGACGACACGAAAGCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999660
ATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGATGGCTCTAGAAACCTTGCGCGATTTGTTGTTGGAAGAAGCAAGGTTTCTATCTGGTGTGGGCGATGAAGTGAGGGAGCTCGAGATCCAGCTGAAACAGATGAAGTGTCTCCTCGAAGATGCTGACAGAAGACGACACGAAAGCAAAACCATTTTCAATTTGATCTCGGAGATCAGAGATCTTGTCTATGGAGCCGAAGCTGCCATTGAAAGACACGCAGCTTATCAAGTGTGTTCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781242.1
MAEAVVSMALETLRDLLLEEARFLSGVGDEVRELEIQLKQMKCLLEDADRRRHESKTIFNLISEIRDLVYGAEAAIERHAAYQVCSRRRRGLRQLVRRCSCSLEEYKSIHQLGSEISPIKSRLERINKEMQENGIKKSIINTTNGGESSAAGENKNWSRKTFPDFEIGECFVGMEEELKQLEYLLVEDKEHRVISVWGMGGSGKTTIARKVYNHIKHTKSSCFESFAWVCISQQCQVKSVLEDILSQLRLEKVNENNASD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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