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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000122`

染色体: Chr08 坐标: 767941-771595 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000122`
名称	SmilChr08G000122
描述	(+)-neomenthol dehydrogenase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	767941 - 771595 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999746`
GeneID	`130999746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999746`
原始查询	`LOC130999746`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(+)-neomenthol dehydrogenase
产物	(+)-neomenthol dehydrogenase
Arabidopsis	`AT3G59710` (AT3G59710) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825140] identity=60.4; qcov=0.96; evalue=1.89e-128; confidence=high
Rice	`Os02g0607700` - identity=59.4; qcov=0.96; evalue=5.59e-108; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	smil00590 (Arachidonic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF01370 (Epimerase); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781347.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057781347.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057781347.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781347.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:768082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C61
`Chr8:768104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:768105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:768113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr8:768167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B82
`Chr8:768219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B16,B49,C56
`Chr8:768245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B16,B49,C56
`Chr8:768323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:768375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C61
`Chr8:768393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:768400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C14
`Chr8:769046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B41,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781347.1

300 aa

150

300

adh_short

Epimerase

adh_short_C2

adh_short

PF00106 adh_short 28-167 aa PF08659 KR 29-146 aa PF01370 Epimerase 30-162 aa PF13561 adh_short_C2 33-163 aa PF13561 adh_short_C2 210-258 aa PF00106 adh_short 215-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781347.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	28	167	4.8e-39	134.6	short chain dehydrogenase
`XP_057781347.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	29	146	4e-10	40.6	KR domain
`XP_057781347.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	30	162	3.5e-07	30.6	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057781347.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	33	163	4.9e-28	99.0	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057781347.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	210	258	4.9e-28	99.0	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057781347.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	215	258	4.8e-39	134.6	short chain dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925364.1
TTTTCATAGTATCTTACATTTTGCATAGTCTTGAAAAATGTCGAATAAAGAGGAAGCAAACACCATTCTTGTTTCTCCTATTTGCCATCCATTATCAAGGTGGTGGTCGAAGGAGACGGTAGCGATAGTCACCGGAGCTAACAAGGGCATCGGGTTTGCCCTAGTTAGGCGGCTGGCGGAGCTAGGGCTCACGGTGGTTCTGACGGCCAGAGACGGCGGCCGCGGCCTCGCGGTGGTTGAATCGTTGAAGAATGAAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999746
ATGTCGAATAAAGAGGAAGCAAACACCATTCTTGTTTCTCCTATTTGCCATCCATTATCAAGGTGGTGGTCGAAGGAGACGGTAGCGATAGTCACCGGAGCTAACAAGGGCATCGGGTTTGCCCTAGTTAGGCGGCTGGCGGAGCTAGGGCTCACGGTGGTTCTGACGGCCAGAGACGGCGGCCGCGGCCTCGCGGTGGTTGAATCGTTGAAGAATGAAGGCTTGCATGTTCACTTTTGTTGCCTTGATATTTCTGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781347.1
MSNKEEANTILVSPICHPLSRWWSKETVAIVTGANKGIGFALVRRLAELGLTVVLTARDGGRGLAVVESLKNEGLHVHFCCLDISDQNSIEKFVSWFQQAFGVVDILINNAAVSFNELDGNSVEQAETVVRTNFYGPKMLTEALLPLFRRQSTAARILNISSRLGLLNKLKNPKFKAMLLDEENLSESQIEGMINLFLEDVKNGTWKSNGWPQIWTDYAVSKLALNSYSNILARRYKGKDLSVNCICPGFTQTSMTGGKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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