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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004140`

染色体: Chr01 坐标: 59897665-59899421 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004140`
名称	SmilChr01G004140
描述	11S globulin seed storage protein Ana o 2.0101-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59897665 - 59899421 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999758`
GeneID	`130999758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999758`
原始查询	`LOC130999758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11S globulin seed storage protein Ana o 2.0101-like
产物	11S globulin seed storage protein Ana o 2.0101-like
Arabidopsis	`AT5G44120` (CRA1) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834435] identity=44.5; qcov=0.967; evalue=8.73e-135; confidence=medium
Rice	`Os10g0400200` (Glua2*) - identity=43.2; qcov=0.945; evalue=1.93e-127; confidence=medium
GO	GO:0045735 (nutrient reservoir activity)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057781365.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057781365.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057781365.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781365.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59897819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C19,C75
`Chr1:59897975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B74,C45,D3
`Chr1:59898024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C51,C67,D7
`Chr1:59898075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C23
`Chr1:59898305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:59898377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:59898510`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A10,A13,A22,A4,B106,B108,B136,B23,B25,B32,B37,B4,B52,B53,B54,B58,B64,B72,B73,B76,B8,B81,B82,B88,B93,C19,C21,C22,C32,C56,C58,C6,C81,C85,D11,D5
`Chr1:59898514`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A10,A13,A22,A4,B106,B108,B136,B23,B25,B32,B37,B4,B52,B53,B54,B58,B64,B72,B73,B76,B8,B81,B82,B88,B93,C19,C21,C22,C32,C56,C58,C6,C81,C85,D11,D5
`Chr1:59898515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B53,B74,C45,D3
`Chr1:59898574`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A10,A13,A7,B106,B37,B4,B52,B54,B58,B72,B73,B93,D5
`Chr1:59898625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B126
`Chr1:59898668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C58,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781365.1

488 aa

244

488

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 72-225 aa PF00190 Cupin_1 313-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781365.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	72	225	7.6e-68	227.6	Cupin
`XP_057781365.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	313	460	7.6e-68	227.6	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925382.1
AATATCATATGTGGAAGTCATTAAAGCTGTGTACACATGCACATTGCAAAATGGCAAACTCCATCTCATTATGTGTCAATCTCATACACTCTTCTTCTCCTCTATAAATCTCCATCACCTTTTCACTCAAAATTCATCTCCTCACTATACTCTTCCAGTAATTTCAGCCATGGGTAGAACCTTCCTCTCAGCTCTCGGCCTTGTTCTGCTCCTCAGCTCCGCCTCCGCCTACAAAGGCAGCGCCGGAAGCTGGCAGCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999758
ATGTGTCAATCTCATACACTCTTCTTCTCCTCTATAAATCTCCATCACCTTTTCACTCAAAATTCATCTCCTCACTATACTCTTCCAGTAATTTCAGCCATGGGTAGAACCTTCCTCTCAGCTCTCGGCCTTGTTCTGCTCCTCAGCTCCGCCTCCGCCTACAAAGGCAGCGCCGGAAGCTGGCAGCGCGGGGAGTGCGATATCTCTAGGATCAACACCCAGGAGCCGTCGTCCCGCCTGGAATCCGAAGGCGGAGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781365.1
MCQSHTLFFSSINLHHLFTQNSSPHYTLPVISAMGRTFLSALGLVLLLSSASAYKGSAGSWQRGECDISRINTQEPSSRLESEGGVSEFWDHNADEFRCAGVSFHRHTIRSRGLMLPAYHNAPVLAYVIQGRGIFGVLISGCPETFESPQQQSAERQRGEKFTDRHQQIEYLKQGDVIAIRAGDAHWAYNNGDEELVVVVLQDNSNNANQLDQNPRSFLLAGNPERQQQMQHQQRFRGQEQQHQLGNVFRGFRTELLAEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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