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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000137`

染色体: Chr08 坐标: 859480-866768 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000137`
名称	SmilChr08G000137
描述	BAG-associated GRAM protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	859480 - 866768 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999762`
GeneID	`130999762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999762`
原始查询	`LOC130999762`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BAG-associated GRAM protein 1
产物	BAG-associated GRAM protein 1
Arabidopsis	`AT3G59660` (AT3G59660) C2 domain-containing protein / GRAM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825135] identity=69.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0516900` - identity=65.8; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF02893 (GRAM); PF16016 (VASt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057781368.1`
2	Endosome	内体	0.60000	`XP_057781368.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057781368.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057781368.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057781368.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:859900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:861042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D7
`Chr8:861125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:862473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C29
`Chr8:863060`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B16,B32
`Chr8:863060`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B16,B32
`Chr8:863062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B32
`Chr8:863299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:864519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D8
`Chr8:864526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C37
`Chr8:865083`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A22,A4,B11,B111,B112,B118,B14,B2,B25,B26,B28,B29,B32,B35,B4,B40,B84,B94,C1,C26,C3,C4,C43,C44,C59,C72,C76,C82,D10
`Chr8:865148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781368.1

583 aa

292

583

GRAM

VASt

PF00168 C2 78-174 aa PF02893 GRAM 227-300 aa PF16016 VASt 400-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781368.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	78	174	8.6e-17	62.0	C2 domain
`XP_057781368.1`	Pfam	`PF02893`	GRAM	Domain	227	300	1.3e-16	61.1	GRAM domain
`XP_057781368.1`	Pfam	`PF16016`	VASt	Domain	400	545	1.4e-31	110.6	VAD1 Analog of StAR-related lipid transfer domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925385.1
AACAGATTCAGCATTTTATATTTTTGTATACTTTCCCTGCCTCGTTTTCTCCCTCCCTTCGTTGACTGTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACGTACACAAACTCTCTCTCTCTCTATATATCATGCACGCAAAGCGCACACACTGAGCGTGTAACTGCGTGTTGATTTCGGCATCCGAGGCTCCTGAATCCCTGTGTATAGCCGGTCCTTCTGTTTTTCACGCCGTCGGTGGGCGTCCGGTGCGGTTCGTGCAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999762
ATGGGGGCGACGATGGTGGTGGAGACCGCGATGGAGCTCCTGGTGCCGTCGTGGTGGGAGGTGCAAGTGACGGTGGCGGCGGCGGCGTTCGTCGTGGTGGCATACTGGTTCTTCTCCGCAGGCGGGGGCGGTGGTGATGATCGGGCATTCGAGGAAAGCGGCGCGGATATGATTGAAGAAAAGGATAAGATGCTATTTAAAGGAGATTCTCAAACTAATTCAGCATACTTAATTAAGGTAGAGCTGTTAGCCGCAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781368.1
MGATMVVETAMELLVPSWWEVQVTVAAAAFVVVAYWFFSAGGGGGDDRAFEESGADMIEEKDKMLFKGDSQTNSAYLIKVELLAAKNLIGANLNGTSDPYAIITCGSEKRFSSMVPGSRNPMWGEEFNFSVDELPVEINVTIYDWDIIWKSAVLGSVIIRVEHEGQTGAVWYTLDSPSGQVCLHIRTLKLQMNSSRVLNGYAGTNPRRRPLDKQGPTVVHQKPGPLQTIFNLLPDEVVEHSYSCALERSFLYHGRMYVSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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