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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000173`

染色体: Chr08 坐标: 1184019-1185705 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000173`
名称	SmilChr08G000173
描述	chitinase 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1184019 - 1185705 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999795`
GeneID	`130999795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999795`
原始查询	`LOC130999795`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chitinase 5-like
产物	chitinase 5-like
Arabidopsis	`AT3G54420` (EP3) homolog of carrot EP3-3 chitinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824608] identity=62.5; qcov=0.908; evalue=1.14e-89; confidence=high
Rice	`Os04g0493400` (Cht4(t)*(Chi4)) - identity=61.8; qcov=1.02; evalue=1.04e-96; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006032 (chitin catabolic process); GO:0016998 (cell wall macromolecule catabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00182 (Glyco_hydro_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057781423.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057781423.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057781423.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781423.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1184228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr8:1184237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C5,C51
`Chr8:1184238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:1184255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:1184264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:1184273`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A22,B106,C21
`Chr8:1184273`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A22,B106,C21
`Chr8:1184282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C65,C78
`Chr8:1184288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B41,B86,C49,C87
`Chr8:1184299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B35,C19,C65,C78
`Chr8:1184301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:1184350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,C32,C45,C68,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781423.1

229 aa

114

229

Glyco_hydro_19

PF00182 Glyco_hydro_19 34-174 aa PF00182 Glyco_hydro_19 182-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781423.1`	Pfam	`PF00182`	Glyco_hydro_19	Domain	34	174	1.1e-49	170.1	Chitinase class I
`XP_057781423.1`	Pfam	`PF00182`	Glyco_hydro_19	Domain	182	229	1.1e-49	170.1	Chitinase class I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925440.1
TAATCCATTTGTAACAAACTTCCAATCTTCCTAGCTTCAAGATATCTTCCTCTTCCCATTATCCTTCTAAAAATAAAATAAAAAAATGGAGTATATATTTATTTCACTCTTTAAATACCCATAAATCCCCACATTATTTCTCCACACCAACACAACATTTTCTCACTACTCTTAGCTATCTCCAAAATGAACCATTCCCTCACTATCTACGCCCTTCTCGCTCTCCTCCTAGCCACCGGAAAATACGTCTCCGGCCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999795
ATGAACCATTCCCTCACTATCTACGCCCTTCTCGCTCTCCTCCTAGCCACCGGAAAATACGTCTCCGGCCAAAACAACGGAGGCAATGTCGGCGGCGTGGTGACAGATAGTTTCTTCAACGGCATTGCTAATCAGGCGGGGGCGGGCTGCGCTGGGAAGGGATTCTACACACGCGCCGCCTTCCTACAAGCGATTCAGCTGTACCCCAACTTCGGCATGGTGGGGTCCGCCGACGACTCGAAGCGTGAGATCGCGGCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781423.1
MNHSLTIYALLALLLATGKYVSGQNNGGNVGGVVTDSFFNGIANQAGAGCAGKGFYTRAAFLQAIQLYPNFGMVGSADDSKREIAAFFAHVTHETGHMCYTREINKAVYCSSNKQWPCTPGQSYYGRGPLQLTWNYNYGPAGQALNFDGLNNPDIVARDPAISFKAALWFWMNSVHTAITSGRGFGATIRAINGGECDGGRPAAVTARVNYYTSYCNQFGVNPGPNLRC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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