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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000246`

染色体: Chr08 坐标: 1705289-1719511 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000246`
名称	SmilChr08G000246
描述	putative disease resistance protein RGA4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1705289 - 1719511 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999809`
GeneID	`130999809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999809`
原始查询	`LOC130999809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA4
产物	putative disease resistance protein RGA4
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=30.5; qcov=0.883; evalue=2.91e-116; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=31.2; qcov=1.08; evalue=3.19e-134; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23247 (LRR_RPS2); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781443.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781443.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781443.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781443.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781443.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1715139`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A19,B62,C18
`Chr8:1715139`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A19,B62,C18
`Chr8:1715140`	`CA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A19,B62,C18,C20
`Chr8:1715146`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A1,A15,A18,B101,B115,B12,B121,B122,B123,B124,B126,B133,B134,B139,B16,B18,B23,B24,B25,B30,B38,B42,B45,B57,B63,B66,B7,B72,B76,B80,B82,B92,B94,C21,C25,C27,C28,C31,C33,C34,C48,C49,C5,C61,C62,C64,C66,C77,C78,C81,C82,C85,C86,D1,D5,D7
`Chr8:1715152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B20,B80,C87
`Chr8:1715153`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A24,B73,B78,C68
`Chr8:1715153`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A24,B73,B78,C68
`Chr8:1715168`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A10,A5,A6,B111,B120,B125,B13,B136,B16,B23,B26,B28,B29,B3,B34,B35,B4,B47,B51,B54,B63,B65,B66,B71,B76,B83,B85,B90,B95,B96,C11,C19,C23,C27,C29,C36,C39,C40,C48,C53,C62,C69,C82,C9
`Chr8:1715231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C64
`Chr8:1715234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C52
`Chr8:1715239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:1715251`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B5,B73,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781443.1

1102 aa

551

1102

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

LRR_RPS2

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 8-94 aa PF00931 NB-ARC 190-356 aa PF23559 WHD_DRP 437-508 aa PF23598 LRR_14 566-852 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 686-820 aa PF23247 LRR_RPS2 787-903 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 1008-1069 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	8	94	1.4e-18	67.5	Rx N-terminal domain
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	190	356	1.4e-30	106.9	NB-ARC domain
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	437	508	5.6e-25	87.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	566	852	1.6e-40	139.6	Leucine-rich repeat region
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	686	820	4.1e-42	143.8	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF23247`	LRR_RPS2	Repeat	787	903	4.5e-16	59.9	Plant disease resistance protein RPS2-like, leucine-rich repeats
`XP_057781443.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	1008	1069	4.1e-42	143.8	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925460.1
ATCTTGAGCTTGCATCACTCATCCAATTCTGTTCCTTAATCCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCAATTTCGCTCTTTCTCTCTCTAAGTTATCAGCTAACACAAAGCAAGGAAGCAGCCGTCATTAAAGCGCAGTAGGGAAGTTATCAGCACAAAGAATGGAAGCAGGAGCTGCTGCTGCCGTTGAAGTTCTAGTTCAAAACCTCATCGACCTTTCCAAGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTCTCGACAAAGATGCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999809
ATGGAAGCAGGAGCTGCTGCTGCCGTTGAAGTTCTAGTTCAAAACCTCATCGACCTTTCCAAGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTCTCGACAAAGATGCAGCAAAGCTAGCTGGGAGTCTCGACGTGGTCAAAAATTTCTTGAAGGATGCCGAGACGCGTGAGATCACCAGCGATGCTGTCAAGAGCTGGTTGAAGAAGCTTGAAAACGAGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAACTCAACTATCATATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781443.1
MEAGAAAAVEVLVQNLIDLSKKEISQIRGLDKDAAKLAGSLDVVKNFLKDAETREITSDAVKSWLKKLENEAFDADNVLDELNYHILSKKIKASKPMKAKVLSRFSSPFNSIARPRKMAVRIQEINENLESIKKEATDLGLVARLAIEPTLVDAATFETDSFTLDPIFIGRDDIASEIVGMLTNSITTDDGSVSILAIVGMGGLGKTTLTRKVFNRLKDETRFGLHIWVHVSPNFDPIILLKKILKEVSQQNKQLPSNQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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