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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000310`

染色体: Chr08 坐标: 2171666-2176738 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000310`
名称	SmilChr08G000310
描述	laccase-14-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2171666 - 2176738 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999902`
GeneID	`130999902`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999902`
原始查询	`LOC130999902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-14-like
产物	laccase-14-like
Arabidopsis	`AT5G09360` (LAC14) laccase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830795] identity=50.6; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0696900` (OsLAC25) - identity=50.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999902

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057781577.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781577.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781577.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781577.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781577.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2172021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B15,B88,C87
`Chr8:2173210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:2173277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B97
`Chr8:2173301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:2173356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C57
`Chr8:2173458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:2173535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B74
`Chr8:2173592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:2173598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B77,B84,B97,C43
`Chr8:2173799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:2173880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:2173882`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,B31,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781577.1

567 aa

284

567

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 37-148 aa PF00394 Cu-oxidase 162-308 aa PF07731 Cu-oxidase_2 417-550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781577.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	37	148	5.8e-41	140.0	Multicopper oxidase
`XP_057781577.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	162	308	1.4e-37	129.9	Multicopper oxidase
`XP_057781577.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	417	550	3.5e-44	150.6	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925594.1
TTCAACCCTAATTATAAATGCTGGACAAATTCTTTCCACTCTCACCAACACGTGAACAATAACCAAAATACAGAAGAAAATGTTTCCAGCAGTGAGGATTTTCATAGTGTTGTTCTTAGGTATAATTTTACTTGGAGGCCTAACCCCACTTCATGCTTTAGTTCGTTGCTACAAGTTTGAAGTGATAAAGTCTTCACACAGCAGGCTTTGCAGCAGCAAGACTATGCTAACGATAAACGGACAATTCCCGGGGCCCACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999902
ATGTTTCCAGCAGTGAGGATTTTCATAGTGTTGTTCTTAGGTATAATTTTACTTGGAGGCCTAACCCCACTTCATGCTTTAGTTCGTTGCTACAAGTTTGAAGTGATAAAGTCTTCACACAGCAGGCTTTGCAGCAGCAAGACTATGCTAACGATAAACGGACAATTCCCGGGGCCCACTATATATGCTAGAAGGGGAGATTTGGTGATAGTTGATGTTGCTAATCGTGCTGATCAAAATATAACCATCCATTGGCATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781577.1
MFPAVRIFIVLFLGIILLGGLTPLHALVRCYKFEVIKSSHSRLCSSKTMLTINGQFPGPTIYARRGDLVIVDVANRADQNITIHWHGVKMPRYPWSDGTEFVTQCPIRPGQRFRQRVILSDEEGTLWWHAHSDWTRDTVHGAIVILPPARESFPFPKPHAHFPILLGEWWKADVQQVMEEFLGNGGNPQISNAFLINGQPGHLYPCSIQDIHKFSVEFGKTYHIRLVNAVMENIMFFKIAGHNLTVVGTDGSYTKPLTTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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