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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000345`

染色体: Chr08 坐标: 2394626-2396300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000345`
名称	SmilChr08G000345
描述	uncharacterized acetyltransferase At3g50280-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2394626 - 2396300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999934`
GeneID	`130999934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999934`
原始查询	`LOC130999934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836850]; symbol=AT5G67150; hit=AT5G67150; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836850]; symbol=AT5G67150; hit=AT5G67150; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G67150` (AT5G67150) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836850] identity=38.1; qcov=1.03; evalue=3.06e-81; confidence=medium
Rice	`Os08g0111300` - identity=37.3; qcov=1.04; evalue=9.38e-77; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781623.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781623.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781623.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781623.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2394922`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B114,B58,B85,C17,C18,C53
`Chr8:2394929`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A20,A9,B107,B110,B112,B114,B13,B33,B56,B58,B59,B62,B81,B84,B85,C17,C18,C25,C31,C53,C63,C86,D1
`Chr8:2395025`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B121
`Chr8:2395025`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B121
`Chr8:2395028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr8:2395110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:2395112`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B118,B2,B50,B69,C1,C60,C74
`Chr8:2395114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:2395125`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	99	A13,A14,A16,A2,A20,A25,A4,A5,A6,A9,B1,B102,B105,B107,B108,B109,B111,B112,B114,B120,B125,B13,B132,B133,B140,B21,B28,B29,B3,B32,B33,B34,B36,B39,B4,B42,B45,B47,B48,B53,B54,B58,B59,B62,B67,B74,B78,B79,B8,B81,B84,C14,C15,C16,C18,C19,C22,C25,C26,C29,C31,C32,C34,C37,C39,C4,C42,C45,C46,C47,C49,C50,C51,C53,C55,C57,C58,C62,C63,C67,C68,C7,C71,C73,C76,C78,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D3,D5,D7
`Chr8:2395128`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A13,A16,A18,A2,A25,A4,B102,B105,B108,B111,B112,B114,B125,B132,B133,B140,B21,B24,B3,B32,B34,B36,B39,B42,B47,B53,B54,B58,B74,B84,C18,C19,C22,C25,C26,C29,C4,C42,C46,C47,C49,C50,C51,C53,C57,C62,C7,C78,C80,C81,C83,C87,D3,D5
`Chr8:2395138`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A11,A14,A20,A5,A9,B109,B125,B13,B28,B4,B45,B48,B59,B62,B67,B78,B79,B8,B81,B98,C14,C15,C16,C31,C34,C39,C63,C73,C82,C84,C86,D1,D10,D7
`Chr8:2395144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B120,C41,C72,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781623.1

434 aa

217

434

Transferase

PF02458 Transferase 4-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781623.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	4	427	2.4e-75	254.6	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925640.1
AAATAACGTGACTCGCATGTATAGCTGGCTTCTCAGGCAAATTTCTCTATTTAATCTTCTATTCTACCCAAATTATTTTCTCTCACATCCAAAATTAGAATTTGAAGATGGCAAAAAAAGTTGAGATGCTTTCTTCATCTCTTGTTAGCGGCACTGCTACTGCTTCAATTTCAAGATTGGAGCTTAATCCATGGGATTTACGATTCCTCCCAGTCATCCCCATTCAAACAGGCCTCATATTCCACAGCCCTCACTTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999934
ATGGCAAAAAAAGTTGAGATGCTTTCTTCATCTCTTGTTAGCGGCACTGCTACTGCTTCAATTTCAAGATTGGAGCTTAATCCATGGGATTTACGATTCCTCCCAGTCATCCCCATTCAAACAGGCCTCATATTCCACAGCCCTCACTTTCAATCCCAACAAAACCTAATCCAACACCTCAAAAACTCCCTCTCACGCGCTCTCGACTTCTTCCCTCCCCTCGCCGGCCGCCTCGTCGCCACCCCGCACGGCGGCGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781623.1
MAKKVEMLSSSLVSGTATASISRLELNPWDLRFLPVIPIQTGLIFHSPHFQSQQNLIQHLKNSLSRALDFFPPLAGRLVATPHGGDMASFFVACNNAGAEFTHAVAAAVSVSDIVEPRYIPEIVSSLFPINVGVTNYQGISKPLLAVQVTELADGVFIGCIANHAVADGTSFWHFFKSWSEISRGSESISKSPIFDRRSAAAGVDDNRLIHIPTLEENLMAPSQLPPQLKVFHFSKEKLGELKAKANSEAGTDKISTLQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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