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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000357`

染色体: Chr08 坐标: 2454240-2456687 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000357`
名称	SmilChr08G000357
描述	uncharacterized SmilChr08G000357
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2454240 - 2456687 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999946`
GeneID	`130999946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999946`
原始查询	`LOC130999946`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox616; symbol=OsFbox616; hit=Os11g0584100; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox616; symbol=OsFbox616; hit=Os11g0584100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G03390` (AT5G03390) - identity=24.2; qcov=1.01; evalue=1.3e-08; confidence=weak
Rice	`Os11g0584100` (OsFbox616) - identity=25.7; qcov=1.04; evalue=5.15e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781635.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057781635.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781635.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781635.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2454496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:2454568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C84
`Chr8:2454597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:2454598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:2454639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:2454650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B50,B97,C61
`Chr8:2454653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:2454655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B135,B21,B24,C51
`Chr8:2454656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B44,B97
`Chr8:2454755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C78
`Chr8:2455393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B113,C70
`Chr8:2455395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B125,B132,B17,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781635.1

361 aa

180

361

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 36-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781635.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	36	333	9.5e-45	153.7	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925652.1
TCCACAATTCCAAACTTTTGTTTCCTAATAGGAATAAGAAACAAATTAAAATCCCAACAAAATTACAAATTAGTTTAAGTAAATCGAAGTGAGATGATCAATTATATACCATTTACCAATACTTTCTCGAATCAAACGATATATACACCAATATGGAAATAAAAATATACCTACCAAATCAAGAACTCAAACCCCACAACTTTTATACTAATTACAACTAATTAATTAAAGCAACTATAAAGTTAATATAATTTCAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999946
ATGCACAAATCATCATCAACTCAAAGCTCTCAAACAATGGCTTCTTCCCCATTCCTCATGCTCCCTCTTCTCGACCAAACCACCCAAGAAATCCATCACCTCTCTCTCTACAATCTCAAAGACAAGAAGCCCCACAACCTCAAATTCCTCGAAACCCTAAAAAACCTCAAAAACCCACAATGCATTGGCTCCTCCCATGGCTTCCTAGCTTTCTTGGACGAAACTAAAGCAAACCCTTTTCTCCTCAACCCTTTCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781635.1
MHKSSSTQSSQTMASSPFLMLPLLDQTTQEIHHLSLYNLKDKKPHNLKFLETLKNLKNPQCIGSSHGFLAFLDETKANPFLLNPFTNAQIHLPPKETKISKLILSQSPTSHPTTFAAVAMHAAGFGLTANLSLCRGGDAAWRRLPGQGETYYDVVCCSVTNTLLALAPGPTVESWDLNEEASPEKTVVIQESCPRSLQLARKTFPADLYTSQWYLALSPAGEIFMAVRYIGEFVSNDGEVVYEGDTLTDDSPAPVICPYR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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