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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000358`

染色体: Chr08 坐标: 2457131-2462581 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000358`
名称	SmilChr08G000358
描述	uncharacterized protein At3g49140
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2457131 - 2462581 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999949`
GeneID	`130999949`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999949`
原始查询	`LOC130999949`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825099]; symbol=AT3G59300; hit=AT3G59300; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825099]; symbol=AT3G59300; hit=AT3G59300; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G59300` (AT3G59300) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825099] identity=52; qcov=0.987; evalue=5.19e-157; confidence=high
Rice	`Os01g0899500` (P0506A10.38-1) - identity=45; qcov=0.968; evalue=1.18e-125; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999949

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781639.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057781639.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2457376`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	87	A15,A16,A18,A2,A20,A3,A4,A7,A9,B101,B103,B106,B115,B117,B118,B12,B120,B128,B13,B130,B134,B137,B15,B22,B26,B27,B30,B33,B37,B40,B45,B51,B53,B55,B62,B67,B7,B74,B75,B78,B80,B83,B84,B85,B87,B9,B91,B92,B95,B98,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C2,C22,C28,C33,C39,C4,C41,C42,C43,C49,C55,C58,C59,C60,C65,C67,C69,C7,C70,C71,C79,C80,C81,C82,C83,C85,C9,D10,D2,D5,D7
`Chr8:2457381`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A10,B66,C38,C65
`Chr8:2457381`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A10,B66,C38,C65
`Chr8:2457417`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A15,A16,A18,A2,A20,A22,A3,A9,B101,B106,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B128,B13,B134,B137,B15,B22,B26,B27,B30,B33,B37,B40,B49,B51,B52,B55,B62,B67,B69,B7,B74,B75,B78,B80,B83,B84,B9,B91,B92,B95,B98,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C22,C27,C28,C30,C33,C37,C39,C41,C42,C43,C49,C5,C55,C58,C59,C65,C66,C67,C69,C7,C72,C77,C79,C80,C83,C9,D1,D10,D2,D4,D5,D7
`Chr8:2457619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:2457645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B114,C47,C54
`Chr8:2457924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C8,D11
`Chr8:2457929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B64,C29,C49,D4
`Chr8:2458719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:2458862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D11
`Chr8:2459657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:2459663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B86,C13,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925656.1
CAATATTTATCAAAATGAAGCCACGTGCAGGTCAATTGTTTCTCTCTCTATCTCACTCTATCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACAGAGCTGGGCCATTAAAGCTATCCAGTGGATCAGCAGCAGTCAGTGGAAGTAATTGCAAGTTATATGTGACAAACGAGGTAAGACAGCAGCGTCTTCAGCATAAGCCGGGCCCATTCAATTCAAACGCTGATTCAACAATTTGCGGCTGCGATTAATCTCCTCTCCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999949
ATGCTGGCTTCAACTGCAGCGGCACCATCCTCATCCTCTTTCTCGCTAGGTGGCTCAGCTTGTTCTAACTGCCTCAGATGTCATGTTGAACCCATGATCTGCTCAACGTCATATGGATTCTCTGGCAGTTCGATTAAGGCTCCATTTGAGCTTCAAAGAATTTCTCAGTATTCAGGCTTGAGAAGAGAACATCTGTTTGGGAGTGCTCAGTTTCACTGGTCGCTTCAGGGGCGTGATATTTGTGTTTCACAAGTTTCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781639.1
MLASTAAAPSSSSFSLGGSACSNCLRCHVEPMICSTSYGFSGSSIKAPFELQRISQYSGLRREHLFGSAQFHWSLQGRDICVSQVSVAADYSDSVPDSSSYATGYHPLEELRDHGRARDTMPTSAEIARTAVEANSKALLIFPSSVHSEPHEQISWAEFDYVIDDFGDIFFEVHDSQNILQDHGASNPVTALIGMDISYYESRKMELLDDILDFDAGDDDLFADDYFEVEEPNKAGISIDWGMPENSNWTHPVYFAKCLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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