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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000364`

染色体: Chr08 坐标: 2511374-2512397 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000364`
名称	SmilChr08G000364
描述	dirigent protein 10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2511374 - 2512397 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999957`
GeneID	`130999957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999957`
原始查询	`LOC130999957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 10
产物	dirigent protein 10
Arabidopsis	`AT1G07730` (AT1G07730) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745746] identity=64.3; qcov=0.829; evalue=1.77e-87; confidence=high
Rice	`Os01g0155300` (P0011G08.16) - identity=59.7; qcov=0.829; evalue=9.2e-82; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057781651.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057781651.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781651.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781651.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2511444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C68
`Chr8:2511444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr8:2511478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B134,B92
`Chr8:2511483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr8:2511488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B28
`Chr8:2511518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr8:2511519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:2511536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B68,B97,D10
`Chr8:2511571`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A4,A5,A8,B100,B106,B124,B135,B18,B20,B21,B26,B28,B35,B40,B48,B50,B53,B57,B59,B66,B67,B72,B78,C16,C2,C20,C21,C41,C5,C51,C61,C77,C82,C85,D7,D9
`Chr8:2511585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C9
`Chr8:2511591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:2511692`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B26,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781651.1

287 aa

144

287

Dirigent

PF03018 Dirigent 166-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781651.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	166	284	2.6e-28	99.3	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925668.1
ACCCTCAATTCTTTCCACAATCGCACCAACACCAAAAACATCAAACACCTTCTAATTTACTATGGCGTTTCAACTCAAATCCACCATCTCCCTCCTCATCCTCGCCCTCGCCATCTACTCTGCCGCCTCCGCCCGAATCCTCGACGAGGAGGCGGCGGACCCCACCGCTACCACTCCCGCCATCAATGCCGGGGCGGGAGCGGGAGCAGGGGCAGGCGCGGGCGAGCACCCACTAACCTTCTTCATGCACGACATACTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999957
ATGGCGTTTCAACTCAAATCCACCATCTCCCTCCTCATCCTCGCCCTCGCCATCTACTCTGCCGCCTCCGCCCGAATCCTCGACGAGGAGGCGGCGGACCCCACCGCTACCACTCCCGCCATCAATGCCGGGGCGGGAGCGGGAGCAGGGGCAGGCGCGGGCGAGCACCCACTAACCTTCTTCATGCACGACATACTCGGCGGGAGCCGGCCCTCGGCCATCGCGGTGACGGGCATCGTCGCCAACCCGGCCGTGGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781651.1
MAFQLKSTISLLILALAIYSAASARILDEEAADPTATTPAINAGAGAGAGAGAGEHPLTFFMHDILGGSRPSAIAVTGIVANPAVGGQVPFAKPNGAVLPVNSGVPTNNANGGIVNNNNVPFLTGLSGFASNVGTNNNNNNNNNNNGIIGGMPGFPVLNSAQFPSGSTLQKLMFGTMTVFDDEATEGHDLGSGLVGKAQGFYIASSEDGNSQTMAFTVMFAAGGYADSLSFFGVHRTAVAESHLAIMGGTGKHVNAKGFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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