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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000367`

染色体: Chr08 坐标: 2528612-2530158 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000367`
名称	SmilChr08G000367
描述	3-ketoacyl-CoA synthase 12
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2528612 - 2530158 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999960`
GeneID	`130999960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999960`
原始查询	`LOC130999960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-ketoacyl-CoA synthase 12
产物	3-ketoacyl-CoA synthase 12
Arabidopsis	`AT2G28630` (KCS12) 3-ketoacyl-CoA synthase 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817412] identity=63.6; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0472900` (OSJNBb0094K03.7) - identity=58.9; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02797 (Chal_sti_synt_C); PF08392 (FAE1_CUT1_RppA); PF08541 (ACP_syn_III_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057781655.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057781655.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781655.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781655.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2528754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:2528803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:2528817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:2528877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C47
`Chr8:2528970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:2529009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:2529019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:2529084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B114,C41,C43
`Chr8:2529099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:2529108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B106,B40,C21
`Chr8:2529213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B57,B69,C61
`Chr8:2529279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781655.1

466 aa

233

466

FAE1_CUT1_RppA

ACP_syn_III_C

Chal_sti_synt_C

PF08392 FAE1_CUT1_RppA 26-305 aa PF08541 ACP_syn_III_C 334-415 aa PF02797 Chal_sti_synt_C 337-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781655.1`	Pfam	`PF08392`	FAE1_CUT1_RppA	Family	26	305	6.4e-111	371.0	FAE1/Type III polyketide synthase-like protein
`XP_057781655.1`	Pfam	`PF08541`	ACP_syn_III_C	Domain	334	415	6.5e-16	59.0	3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal
`XP_057781655.1`	Pfam	`PF02797`	Chal_sti_synt_C	Domain	337	412	3.3e-08	34.4	Chalcone and stilbene synthases, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925672.1
TCCTCATCCACCATTATTATAAGCCTCTCTCTCCCTCCATTTTCCCCAACTCAACAAATTTTGAAGAAAGCATGGATCTTATAGACCTCTTTCTCTCCCTCCTCTTCCTCCTCCCCCTCCTCCACCTCCTACGGGCGGCGTACGACCGCCGCCGCTGCTACATCCTCGACTACGAGTGCTACAAGCCCGGCGACGAGCGCAAGCTCAGCACCAAATTCTCCGGCGAGATCATCCGCCGCAACAAGCAGCTCGGCCTCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999960
ATGGATCTTATAGACCTCTTTCTCTCCCTCCTCTTCCTCCTCCCCCTCCTCCACCTCCTACGGGCGGCGTACGACCGCCGCCGCTGCTACATCCTCGACTACGAGTGCTACAAGCCCGGCGACGAGCGCAAGCTCAGCACCAAATTCTCCGGCGAGATCATCCGCCGCAACAAGCAGCTCGGCCTCTACGAGTACAAATTCCTCCTCAAGACCATCGTGAGCTCCGGCATCGGCGAGGAGACCTACGCCCCGCAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781655.1
MDLIDLFLSLLFLLPLLHLLRAAYDRRRCYILDYECYKPGDERKLSTKFSGEIIRRNKQLGLYEYKFLLKTIVSSGIGEETYAPQMVFDGREASATLADGLVEMDEFFLESVGALLKRTGVGPAEIDLLVVNISMLSTAPSLSSRIINLYKMRDDVKVYNLAGMGCSASLIAVNVVENVFRCRKDSVALVVTSESLSPNWYMGKDRSKMLANCLFRTGGCAVILTNKAELADRAMFRLKTLVRTHHGASDDAYSCCEQKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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