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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000396`

染色体: Chr08 坐标: 2783361-2789104 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000396`
名称	SmilChr08G000396
描述	disease resistance protein RGA2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2783361 - 2789104 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999987`
GeneID	`130999987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999987`
原始查询	`LOC130999987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RGA2-like
产物	disease resistance protein RGA2-like
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=30.4; qcov=0.91; evalue=1.17e-110; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=31.1; qcov=1.04; evalue=5.25e-130; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781683.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781683.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781683.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781683.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2783721`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	223	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C7,C70,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr8:2783725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A5,B10,B132,B15,B74,B75,B80,B83,B93,C30,C46,C53,C65,C72,C84,D5,D6
`Chr8:2783726`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	B100,B106,B110,B125,B135,B14,B21,B22,B24,B62,B69,C14,C31,C42,C80
`Chr8:2785484`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B49,B81,C80
`Chr8:2785484`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B49,B81,C80
`Chr8:2785544`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B129,C17
`Chr8:2785580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,B58,C24
`Chr8:2785584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B29,B42,B66
`Chr8:2785587`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A14,B10,B107,B121,B24,B25,B55,B6,B67,B69,B78,B83,B88,B99,C42,C5,C53,C59,C61,D10,D2,D5
`Chr8:2785594`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A14,B10,B107,B67,B78,B83,B99,C5,C53,C59,D2,D5
`Chr8:2785617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B31,C75
`Chr8:2785619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781683.1

1137 aa

568

1137

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 9-97 aa PF00931 NB-ARC 172-338 aa PF23559 WHD_DRP 431-498 aa PF23598 LRR_14 543-845 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 659-782 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 1037-1098 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781683.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	97	2.6e-19	69.8	Rx N-terminal domain
`XP_057781683.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	172	338	6.3e-36	124.3	NB-ARC domain
`XP_057781683.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	431	498	2.1e-22	79.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781683.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	543	845	4.3e-47	161.3	Leucine-rich repeat region
`XP_057781683.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	659	782	1.5e-47	161.4	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057781683.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	1037	1098	1.5e-47	161.4	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925700.1
CATTTACCACATAGTCAAAGTCATAGTTTTAAAAAAGTGTCGGCAAAGATTAAATATATAAAATGAAAAAAGAAAACCTTATCTTCGAATGAAAGGCTGTAAACTCTTCTGCTTGAACACTCATCCAATTCTATTCCATAGCTTTCTCTCTCTCACTCAATTTCTCTCTCTCTCTCTCCTCAAAAAAATTCTCTCTTTCTCTCTCTAAGTTATCGGCACAAAGAATGGAAGAAGCTGCTGCTGCCGCCGTCCTTCGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999987
ATGGAAGAAGCTGCTGCTGCCGCCGTCCTTCGAGTTTCAATTCAAAACCTCATCGACTTTCTCAAGAATGAGATCTCTCAAATCCAAGGTCTCGACAAAGAAGCAGAAAAGCTAGCTGGGACTCTCGAAATCATCCAGAAATTCTTGAACCACGCGGAGTCGGGCACCGTCACCGGCGAAGATGTCAAGAGCTGGCTGAGGAAGCTTGAAGACGTGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATAAGCTCAACTATCATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781683.1
MEEAAAAAVLRVSIQNLIDFLKNEISQIQGLDKEAEKLAGTLEIIQKFLNHAESGTVTGEDVKSWLRKLEDVAFDADNVLDKLNYHRLSEQIKPKKAKVLSFFKRIPRSRKMALKIKKIRENLDCINKDAAVLGLKERLAAAVPTLLHAVETDAYALDPIFIGRDDVVSEIVEMLTNSITTDERRVSILPIVGMGGLGKTTLTRKVFNHEMVKTRFESHIWVHVSPNFEPITLLKKILNNLTSDQVENASRQVVLTKLQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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