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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000405`

染色体: Chr08 坐标: 2839032-2840747 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000405`
名称	SmilChr08G000405
描述	putative zinc finger protein CONSTANS-LIKE 11
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2839032 - 2840747 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999993`
GeneID	`130999993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999993`
原始查询	`LOC130999993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative zinc finger protein CONSTANS-LIKE 11
产物	putative zinc finger protein CONSTANS-LIKE 11
Arabidopsis	`AT5G59990` (AT5G59990) CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836121] identity=61.5; qcov=0.425; evalue=8.11e-26; confidence=low
Rice	`Os03g0139500` (OsCCT10) - identity=54.4; qcov=0.421; evalue=1.4e-20; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009909 (regulation of flower development)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781686.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781686.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781686.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781686.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2839212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B88
`Chr8:2839230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B97
`Chr8:2839271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:2839322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B38,B39,B81,C47
`Chr8:2839329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:2839349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B88
`Chr8:2839349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:2839350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B88,C61
`Chr8:2839382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:2839950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B26,D3
`Chr8:2839962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C54
`Chr8:2840207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781686.1

214 aa

107

214

CCT

PF06203 CCT 131-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781686.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	131	172	9.2e-19	67.9	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925703.1
TGGTCCAGGTAGGCCAACACAGCTCCCCCAACTGACAAGATTGCCAAGTCAACGCCCAATCGACCCATGACGTCATCCTCCACGTCATCTTTAACCCCCTTTTAATAAGCTGTCGTGTGCCCACAATGTGCCCATTCCACGCCTTTCATCAAATCCCCCTCCAAAAATAAATCCCTTTCATCAAAAAAATCAAACCTAATTTAATTTCCCTCGTTATATTATATAGTTTCATCCTCACTAAACACACCATAAAAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999993
ATGTCCGGACCATACTGGTATCAACTTTACTCCGATCGTGTTTCGGAACACGACGATCAATTTTCATTGGTGCGCGCGCCCGTTGCTGAGCACGTGTACGAGTCCGTGTTGGGGGAGACGGGGCACAGCAGCAGCGGGTGCAGCAGCCACGTCGACTCCCCGAACTCGAATGGTACTACTTATGGAGCACAGAGTCCTACTCTAATGCAGAGGGAGGTTAGCTGCCACTCTCTCATCAATACAAAAGTGGAAGGTTATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781686.1
MSGPYWYQLYSDRVSEHDDQFSLVRAPVAEHVYESVLGETGHSSSGCSSHVDSPNSNGTTYGAQSPTLMQREVSCHSLINTKVEGYYNIESESSHGSSQWYNKWSNYPFASENSIFESMNRATPYSPEEKKERIERYRSKRNLRNFNKKIKYECRKTLADRRPRVRGRFAKNDEIYTEEATQRPFQEEEDDEYYSWITILDALNKSDAALISSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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