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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000424`

染色体: Chr08 坐标: 3018739-3022777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000424`
名称	SmilChr08G000424
描述	uncharacterized SmilChr08G000424
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3018739 - 3022777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000013`
GeneID	`131000013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000013`
原始查询	`LOC131000013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823704]; symbol=AT3G45620; hit=AT3G45620; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823704]; symbol=AT3G45620; hit=AT3G45620; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G45620` (AT3G45620) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823704] identity=57.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0286800` (OsWD40-67) - identity=52.2; qcov=0.981; evalue=2.5e-175; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0080008 (Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781722.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781722.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781722.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781722.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3018967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:3018971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:3019023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr8:3019088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,A19
`Chr8:3019227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A6,B34,B49,C3
`Chr8:3019253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,A19
`Chr8:3019283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr8:3019285`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A16
`Chr8:3019285`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A16
`Chr8:3019299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C12,C27,C59
`Chr8:3019316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B122,B75
`Chr8:3019316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781722.1

478 aa

239

478

WD40

PF00400 WD40 46-80 aa PF00400 WD40 134-170 aa PF00400 WD40 302-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781722.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	46	80	1.5e-31	108.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781722.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	134	170	1.5e-31	108.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781722.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	302	338	1.5e-31	108.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925739.1
TCGGTAAATGAGCGCAAAAACATTAAGCTATGGAAGCCCAAAGACGCGCATTTATATATCTATAGTTTAAGGGGCTGACAATGACATGAAATCTTAAAAAAACTAAAAACCAAAACCCTTTGGATCAATGATCAATCAATCTACTCATTTCCTGAAACCTCCACTCAAATTCCTCATCATCTTCCTCTCTCTCCCTCTCTAAATCCCCACTGCGTGTTTGCATATGCTATGCGTATGGTGGCGCACGCTTCCGTACATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000013
ATGGAGAGGCGGTACACGAATTCTGATAATTGGTTGAATGAGCTTTACAAGAGAGAGACGGCTTTGTTCCCGCCCAGGATTTGCTCTCGCCGCCTCTCGGCTTCACAGGCTCTGATACAGCGCCTTGGTCTGTATGGGCAACTGAATGGTCATCAGGGATGTGTAAATGCAATTTCATTCAACTCCACCGGCGAGCTGATTGCATCAGGTTCTGATGACCGACAAATTATGCTCTGGGACTGGGCAGCAGAGAAACTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781722.1
MERRYTNSDNWLNELYKRETALFPPRICSRRLSASQALIQRLGLYGQLNGHQGCVNAISFNSTGELIASGSDDRQIMLWDWAAEKLKLSYQSGHTDNVFQAKFMPFTDDSKIISSSADCQVRLGLIQENGSVETKKLSKHQGRVHSLAIEPGSPYVFYSCGEDGFVQHYDLRSCSATKLFYCSSFAENSRSSSVGLNAMVIDPRNPNYFSVGGSDVYARLYDIRKYQVNASTKEGSPANYFCPHHLIGKDDVRITALAYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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