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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000426`

染色体: Chr08 坐标: 3035733-3038508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000426`
名称	SmilChr08G000426
描述	NEDD8-specific protease 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3035733 - 3038508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000016`
GeneID	`131000016`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000016`
原始查询	`LOC131000016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NEDD8-specific protease 1
产物	NEDD8-specific protease 1
Arabidopsis	`AT5G60190` (AT5G60190) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836141] identity=52.7; qcov=0.991; evalue=6.77e-82; confidence=high
Rice	`Os12g0102350` - identity=40.6; qcov=0.978; evalue=1.26e-51; confidence=medium
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity); GO:0019784 (deNEDDylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000016

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781725.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781725.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781725.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781725.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3037681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B106,B14,C82
`Chr8:3037885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B124,B7
`Chr8:3037929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:3037943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3037948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:3037949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:3037957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C87
`Chr8:3037966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B56,B96,D7
`Chr8:3037986`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B113,B15,B75,C51
`Chr8:3037986`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B113,B15,B75,C51
`Chr8:3037998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:3038078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781725.1

224 aa

112

224

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 81-209 aa

XP_057781726.1

224 aa

112

224

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 81-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781725.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	81	209	4.7e-08	33.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057781726.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	81	209	4.7e-08	33.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925742.1
GAAATTAACCCCTTTTTTTCTTATACCCACATTAGTTTCTTTCAATGAAATTCAAATTCTCAAGAGAATAAACAACATAAAACGTAATCACGCCTATTAAGAAAATACATAAAAACGCGTTCCTCAAAACCATATAACTGCTTACCAGATCTTCAGCCACGGCAGTTTCTTTTCCACCACCACAGACACCATGAGAAACAACATTGAGCTGCGCTACTGAGAGAAAAATGGCGCTCGCGACTCCTCATCCTTGGCCGCGT...

XM_057925743.1
TTCAGCCACGGCAGTTTCTTTTCCACCACCACAGACACCATGAGAAACAACATTGAGCTGCGCTACTGAGAGAAAAATGGCGCTCGCGACTCCTCATCCTTGGCCGCGTCTATTTTCCGTCGTCGATTACTGAATTCGCCTCCCGGAGATACCTCGCTTCTCGTGACGGCCACAGTTGCTCCAGAAGACTACAAAGTGATCGAAATTATTGCTCTCCGCTTCCTGTGTGAAACATCTCTTGAAAATGGAGAAAGAAAAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000016
ATGGAGAAAGAAAAGCCCAATGACAAAATACTCAGCTACAACGATGTTGTTCTGAGGCGATCAGATCTCGACATTCTGAGTGGCCGGTATTTTCTCAATGATCGCATAATTGAATTCTACTTTAGCTACCTCACATCCTGCTATCCGTCTGAGGATATCCTCCTGGTGCCGCCTTCAATTTCTTTCTGGATCAAAGAGTGCCCCGACAGTGCCAGCCTCAAAGATTTCGTGGAACCCCTTCATCTGTCCACAAAAAAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781725.1
MEKEKPNDKILSYNDVVLRRSDLDILSGRYFLNDRIIEFYFSYLTSCYPSEDILLVPPSISFWIKECPDSASLKDFVEPLHLSTKKLIIFPINDNEDVTRAEGGSHWSLLVFERDTNAFVHHDSSKSSFNTADAKRVYKAVASYTSSRATYLDCPSSPKQVNGYDCGLYVTAISRSICEWYFSEAPKDVEDLWFPTITEQVTPSLVSNMRREILELVRSLMGMP

XP_057781726.1
MEKEKPNDKILSYNDVVLRRSDLDILSGRYFLNDRIIEFYFSYLTSCYPSEDILLVPPSISFWIKECPDSASLKDFVEPLHLSTKKLIIFPINDNEDVTRAEGGSHWSLLVFERDTNAFVHHDSSKSSFNTADAKRVYKAVASYTSSRATYLDCPSSPKQVNGYDCGLYVTAISRSICEWYFSEAPKDVEDLWFPTITEQVTPSLVSNMRREILELVRSLMGMP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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