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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000431`

染色体: Chr08 坐标: 3091940-3102768 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000431`
名称	SmilChr08G000431
描述	disease resistance protein RGA2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3091940 - 3102768 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000018`
GeneID	`131000018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000018`
原始查询	`LOC131000018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RGA2-like
产物	disease resistance protein RGA2-like
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=30.6; qcov=0.812; evalue=1.29e-106; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=31.27; qcov=0.981; evalue=3.71e-135; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13191 (AAA_16); PF18052 (Rx_N); PF20703 (nSTAND1); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000018

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781729.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3096204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:3096225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B25
`Chr8:3096233`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	97	A15,A16,A19,A25,A3,A4,A9,B10,B102,B103,B104,B109,B11,B111,B112,B119,B121,B122,B13,B130,B131,B134,B138,B140,B17,B2,B21,B22,B23,B24,B35,B38,B45,B48,B58,B59,B6,B62,B65,B67,B69,B72,B76,B77,B81,B83,B87,B9,B90,B93,B95,B97,C11,C13,C16,C19,C20,C24,C26,C27,C28,C31,C32,C33,C35,C38,C39,C45,C48,C53,C54,C56,C59,C60,C61,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C9,D1,D2,D4,D5,D6,D9
`Chr8:3096296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C26,C82
`Chr8:3096299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C26,C82
`Chr8:3096301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr8:3096308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:3096321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B127,B137,B20
`Chr8:3096334`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,B31,C28
`Chr8:3096334`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B114,B31,C28
`Chr8:3096335`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B114,B115,B44,B52,B56,B58,B80,C52,C67
`Chr8:3096336`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A20,A21,A22,B1,B102,B117,B12,B124,B127,B129,B137,B16,B20,B25,B31,B34,B43,B5,B66,B73,B86,C1,C15,C37,C46,C56,C7,C70,C79,C82,C84,C87,D11,D3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781729.1

1188 aa

594

1188

Rx_N

nSTAND1

AAA_16

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 9-95 aa PF20703 nSTAND1 170-349 aa PF13191 AAA_16 172-309 aa PF00931 NB-ARC 183-365 aa PF23559 WHD_DRP 448-519 aa PF23598 LRR_14 580-854 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 692-819 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 1071-1137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	95	8e-20	71.5	Rx N-terminal domain
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF20703`	nSTAND1	Domain	170	349	5.1e-07	30.4	Novel STAND NTPase 1
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF13191`	AAA_16	Domain	172	309	7.3e-08	33.8	AAA ATPase domain
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	183	365	3.4e-33	115.4	NB-ARC domain
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	448	519	7.1e-25	87.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	580	854	1.6e-43	149.5	Leucine-rich repeat region
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	692	819	5.7e-50	169.2	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057781729.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	1071	1137	5.7e-50	169.2	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093639.1
TCATAAAAAAATATTGTTATTTCAGAAATGATGACATTGGAATCTATTTTAAAAATGAAAAACAAAGACTAGATCTAGAAATGGAAAACAGAGTCTAGATCTAAATAGAAATTTTGTAACTCTTGTTCATTTTGCACCAACTCATTCTCTCTCTCACACACAGAGCAGAAAGAAACTCTCTCCCACACACACAAAGAGCTCAGAAACAATGGAAGGAGAAGCTGTTGCAGCCGTCCTTCAAGTTCTGGTTCAAAACCTCA...

XR_009093640.1
AAATGATGACATTGGAATCTATTTTAAAAATGAAAAACAAAGACTAGATCTAGAAATGGAAAACAGAGTCTAGATCTAAATAGAAATTTTGTAACTCTTGTTCATTTTGCACCAACTCATTCTCTCTCTCACACACAGAGCAGAAAGAAACTCTCTCCCACACACACAAAGAGCTCAGAAACAATGGAAGGAGAAGCTGTTGCAGCCGTCCTTCAAGTTCTGGTTCAAAACCTCATCGACGTTTCCAAGAATGAAATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000018
ATGGAAGGAGAAGCTGTTGCAGCCGTCCTTCAAGTTCTGGTTCAAAACCTCATCGACGTTTCCAAGAATGAAATCTCACTAATCCGAGGTCTCGACAAAGAAGCAGCGAAGCTAACTGGGAGTCTCGACACCATCCAGAAGTTCCTCAACGACGCGGAGCAGCGCACCATCCCCGGCGTCGGCGAGGCTGTCAAGAGCTGGCTGAAGAAGCTTGAAGACGTGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAGCTCAACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781729.1
MEGEAVAAVLQVLVQNLIDVSKNEISLIRGLDKEAAKLTGSLDTIQKFLNDAEQRTIPGVGEAVKSWLKKLEDVAFDADNVLDELNYHRLSKEIKHTKPLKAKVLSCFSSSFNSIARPRNMAVRIREINESLDSLHKEGAGLGLKESLAADVPTLLDAATFETASFTVDPIFVGRDDVASEIVEMLTNSIATDERAISILSIVGMGGLGKTTLTREVFNRLKDETETRFGSHIWVHVSPNFDALTLFKKILKDLTSSDQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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