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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004174`

染色体: Chr01 坐标: 60210340-60214173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004174`
名称	SmilChr01G004174
描述	bifunctional TH2 protein, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60210340 - 60214173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000031`
GeneID	`131000031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000031`
原始查询	`LOC131000031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional TH2 protein, mitochondrial-like
产物	bifunctional TH2 protein%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G32470` (AT5G32470) heme oxygenase-like, multi-helical [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833206] identity=50.1; qcov=1.02; evalue=9.23e-180; confidence=high
Rice	`Os08g0566000` - identity=50.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03070 (TENA_THI-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781753.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781753.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057781753.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057781753.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781753.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60211672`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:60211672`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:60212281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:60212427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,D11
`Chr1:60212505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:60212508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B75,C47
`Chr1:60212529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B75,C47
`Chr1:60212694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:60212817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:60212838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B75,C47
`Chr1:60212851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B75,C47
`Chr1:60212907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781753.1

558 aa

279

558

TENA_THI-4

PF03070 TENA_THI-4 31-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781753.1`	Pfam	`PF03070`	TENA_THI-4	Family	31	239	2.4e-13	51.0	TENA/THI-4/PQQC family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925770.1
GTTTTAGGTCGCCATTTTTTTTTGTAGAGATTTAATTGCATTAATTGAGAGGTTGAATACTTTTTTTTTGCGATACAAGAAATCTATCAGTAGTGTAAGGAATCTTTGAAAAAAAGAAAAAGAAATACAGCGAGTAAGGAATTATGCATGTCGGAAAATTCTCCGCTGACTTAAATCTGAAATTGAAATTGAATCCCAGACTCGTTTTTTTCTTGATAACACTAAAGACGCCATGGCTGAATCACGCCCTCCTCACGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000031
ATGGGGAGTGTGGAGGCGGATCATGAAGGCGGCGTAGCCAAGAGGCTGTGGAACAAGTTCAAGAATGGAAGGGCTTTAGCTCTCTACAGCCCTTATATTGTTTGCTTGGCGTCTGGCACCTTGGACCCCACCTCTTTTCTTCATTGCATCTCTCAAGATTTCTACCTTCTTCAAGCTTTTGCTCGGGCATATGAACTAGCAGAAGAGTATGCAGATGATGATGAGGACAAGGAGGCCATTGTCAAGTTGAGAAAGCGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781753.1
MGSVEADHEGGVAKRLWNKFKNGRALALYSPYIVCLASGTLDPTSFLHCISQDFYLLQAFARAYELAEEYADDDEDKEAIVKLRKRVLKRLRNQDALISEWGFEPPKDHTCNDATSKYTEFLMETASGKVGGEKFAVKIVTPFEKTKLAAYTLSAISPCMRLYSFISREIQALLDPDESNNIYKKWLNSLSSEKFEASASRIEDLLDKLSISLTGEELDVVERLYHRAMKLKLDFIWSQSVVQQTIVPFSLLRNSGEDNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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