Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000448`

染色体: Chr08 坐标: 3190541-3191670 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000448`
名称	SmilChr08G000448
描述	uncharacterized SmilChr08G000448
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3190541 - 3191670 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000036`
GeneID	`131000036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000036`
原始查询	`LOC131000036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0004869 (cysteine-type endopeptidase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781754.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781754.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781754.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781754.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3190690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B110,B24,C71
`Chr8:3190798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C16,C33
`Chr8:3190814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:3190817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B123,B83,B99,C59
`Chr8:3190846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C17
`Chr8:3190874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C33
`Chr8:3190917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C1,C8
`Chr8:3191047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:3191222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C40,C84
`Chr8:3191477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3191495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:3191552`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A5,A9,B120,B134,B138,B36,B38,B39,B99,C10,C16,C79,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925771.1
CTCAGTTGCAAATTTCCTTCGTCTCTTTTCTTCTCTCTAGCCTTAATATTTAGCACATAGCTGCAAATTCCCTCTGTTTTTTTTCTGAATTTATACCAATGGAAGAACTTACTTTCGATCCACAATTCTACTCTGAATACATGGATGACGTTAACTACAGCCAGGGATTCTACGTGACGCCGGCGGAAGATGACCTGGTGCTGCGGGGAGGAATCAGGCGCGTCGGAGGCGTCGACCGTCTCCGAAAGGCGGAGCGCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000036
ATGGAAGAACTTACTTTCGATCCACAATTCTACTCTGAATACATGGATGACGTTAACTACAGCCAGGGATTCTACGTGACGCCGGCGGAAGATGACCTGGTGCTGCGGGGAGGAATCAGGCGCGTCGGAGGCGTCGACCGTCTCCGAAAGGCGGAGCGCGCCGCCGTGTTTGCGGTGGAGGAGCACAACAAGGAGGCAGGGGAGAAAGGATTTCTGAAATTCGTCGCGATAGTGAATCTCAACGTGGAGCCCTCCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781754.1
MEELTFDPQFYSEYMDDVNYSQGFYVTPAEDDLVLRGGIRRVGGVDRLRKAERAAVFAVEEHNKEAGEKGFLKFVAIVNLNVEPSAGAIYYITAAVADAAGEICRFQMQIWEKLNTGYKVQMFRPAPYWLKLSEKLARKNCCVAINNLEHWMDENYLYYKCFKAAPEILGIEMEGNTNQAYIWMRKSAHIGWIVNKYEGKEMPRSDIFYTFN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器