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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004178`

染色体: Chr01 坐标: 60222171-60227302 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004178`
名称	SmilChr01G004178
描述	nuclear transport factor 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60222171 - 60227302 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000055`
GeneID	`131000055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000055`
原始查询	`LOC131000055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transport factor 2
产物	nuclear transport factor 2
Arabidopsis	`AT5G43960` (AT5G43960) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834419] identity=47.4; qcov=0.965; evalue=2.57e-100; confidence=high
Rice	`Os02g0131700` - identity=42; qcov=0.943; evalue=1.42e-83; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF02136 (NTF2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781801.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057781801.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057781801.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057781801.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057781801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60222608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:60222979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:60223490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D3
`Chr1:60223521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr1:60224140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:60224221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:60224244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C67
`Chr1:60224867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B93
`Chr1:60226052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781801.1

424 aa

212

424

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 14-128 aa PF00076 RRM_1 324-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781801.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	14	128	4.6e-29	101.9	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057781801.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	324	392	4.1e-10	40.1	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925818.1
ATGCCCCACGAGTTGTAGTCCGACAGTAGAAGAATCAAAGAATTAATCCTATCCGTCGCTACAATATCACATTCGACGGTGAAGATCCTGTCCTCATAAACCCCCACGAAACAGCGGTGACGTAACGCCGGATACACAGCCCAAGCGAAAGAAAATTAAAAAAGAAACGGAAAAAACAGAAATATATAAAAGAATTTATCGTCACTTTACCGAAAAGCCGTTCTCGTAAATCAGAGAAACAGCGGGATAAATTCCTTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000055
ATGGCGAACCAGTACGCAGCTCAGGTCACTGCATCGCAGGTGGGTTCGTACTTCGTTCAACAGTACTATCAGGTGTTTCAGCAGCAGCGGGAGTATGTGCACCAGTTTTACAATGATTCCAGCTCCATGATGCGAGTTGATGGAGAAATCAGCGAGTCTGCGTCGGATATGATGAAAATTCATGAAGTGCTTATGTCTCTTAATTTTTCGGGAATTGAGATCAAGACAATAAAGTCACTTGAATCATGGAATGGAGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781801.1
MANQYAAQVTASQVGSYFVQQYYQVFQQQREYVHQFYNDSSSMMRVDGEISESASDMMKIHEVLMSLNFSGIEIKTIKSLESWNGGVLVVVTGSVKSRDFSYWRKFVQTFFLAPQEKGYFVLNDMFHFADDEVTHQPSAPVHEQHVDYQPTISSHVPDPPVSDYALEEEAGEYGNSVHVEGVEPVQDYSYEEHLRQDPEPEPELELEPEQEPEPEVDRLEEESPFEETSHVLQNPLSTVHEPQLSVEEPVGEPEKLTYAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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