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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000496`

染色体: Chr08 坐标: 3595221-3597220 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000496`
名称	SmilChr08G000496
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3595221 - 3597220 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000088`
GeneID	`131000088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000088`
原始查询	`LOC131000088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 3
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 3
Arabidopsis	`AT5G60800` (AT5G60800) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836201] identity=47.1; qcov=1.01; evalue=9.15e-52; confidence=high
Rice	`Os02g0510600` - identity=30.6; qcov=1.09; evalue=3.15e-25; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781840.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781840.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781840.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781840.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3595535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:3595553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C78
`Chr8:3595601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B44
`Chr8:3595729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B44
`Chr8:3595741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr8:3595793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:3595965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:3596735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:3596892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781840.1

276 aa

138

276

HMA

PF00403 HMA 18-67 aa PF00403 HMA 130-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781840.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	18	67	1e-15	58.5	Heavy-metal-associated domain
`XP_057781840.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	130	179	1e-15	58.5	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925857.1
ATTGACATTCCCATGACAACTCACTCACACGGTCCATAGTCTACACGCACACACACACACACTCACTTTACCCTTTTCTCTCTCGTCTATATAAATCCACCTTCACCACTCAGTTTTACACTTTGCTCACATCATATTCACACACTAGCAATCACAAATTTGACCAGTTTCTCACAATGGGAGAGAAGAAGGAGAAGGAGAGTGGAGGAATCACCGTCGTGCTGAAAGCTGACTTCCACTGCGACGGCTGCGCTTCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000088
ATGGGAGAGAAGAAGGAGAAGGAGAGTGGAGGAATCACCGTCGTGCTGAAAGCTGACTTCCACTGCGACGGCTGCGCTTCAAAAGTTATTAAGTGCATTCGCTCCGTTGATGGCGTCGAGGCTGTGACGATCGACGGCCAGAAGATCACGGTTGTTGGAAGGGTGGATCCGGCGAAGCTCCGGGATAAAGTCGAGCAGAAAACGCACAAGAAGGTGGAGCTGATCTCGCCGCAACCGAAAAAGGATGGCGGCGAGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781840.1
MGEKKEKESGGITVVLKADFHCDGCASKVIKCIRSVDGVEAVTIDGQKITVVGRVDPAKLRDKVEQKTHKKVELISPQPKKDGGEKEKGKDSGGGDGKNEKKKDNEGKKSNDKSDQKKEPPLTTAVLKLNLHCDGCIHKIYKTVTKTKGYKDMKIDTQKDLVTVTGSIDMKALADVLQKQLKRDVAIVPPKNEGEKKEKGGGDGKGKSGGDGGGDGGDENVHGNKMQAPPPGYPYPFISGPGHAVGDQFHYNPYGAQLLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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