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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004168`

染色体: Chr01 坐标: 60182862-60184442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004168`
名称	SmilChr01G004168
描述	uncharacterized SmilChr01G004168
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60182862 - 60184442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000094`
GeneID	`131000094`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000094`
原始查询	`LOC131000094`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glutathione S-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834423]; symbol=AT5G44000; hit=AT5G44000; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glutathione S-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834423]; symbol=AT5G44000; hit=AT5G44000; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G44000` (AT5G44000) Glutathione S-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834423] identity=69.7; qcov=0.906; evalue=4.38e-179; confidence=high
Rice	`Os02g0814800` - identity=56.1; qcov=0.922; evalue=4.12e-140; confidence=high
GO	GO:0004364 (glutathione transferase activity); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00043 (GST_C); PF13409 (GST_N_2); PF13410 (GST_C_2); PF14497 (GST_C_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000094

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781847.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057781847.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057781847.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781847.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60183017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B113,B33,B76
`Chr1:60183266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:60183298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C33
`Chr1:60183385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B131,C29,C9
`Chr1:60183406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B131,C29,C5,C9
`Chr1:60183442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:60183443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A19,B93
`Chr1:60183550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:60183634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C5
`Chr1:60183895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C33
`Chr1:60184201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B70,B84,C41,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781847.1

383 aa

192

383

GST_N_2

GST_C

GST_C_2

GST_C_3

PF13409 GST_N_2 111-208 aa PF00043 GST_C 252-331 aa PF13410 GST_C_2 256-328 aa PF14497 GST_C_3 260-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781847.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	111	208	8.3e-09	36.7	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057781847.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	252	331	1.6e-09	38.5	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057781847.1`	Pfam	`PF13410`	GST_C_2	Domain	256	328	5.7e-14	52.7	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057781847.1`	Pfam	`PF14497`	GST_C_3	Domain	260	337	1.5e-06	29.1	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925864.1
CTTTACATTACTGTGTTGAAAAGATTGAGCCATACCGATTATTGTATTGACTTTCAATTATCTCCAAAATGTTAATTAACAGAAAATAAAGTTCTAAATAATAGTTGAATTAATTTAATGCTAGCAATTGCAGCGAGAACATGAAAGCAATGTCCCGCAGCTCAACATTCCTCGGCTCCCCAGTCCTCCTCCCGCCGCCGGCCGCCACTGTCAGCCGCCGCACAGTAAAAATGTCGGGCACCACCAACCCCATCACAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000094
ATGAAAGCAATGTCCCGCAGCTCAACATTCCTCGGCTCCCCAGTCCTCCTCCCGCCGCCGGCCGCCACTGTCAGCCGCCGCACAGTAAAAATGTCGGGCACCACCAACCCCATCACAACCCTGACCAGACTCCTGTGGGGCCAATCCCTACCCCCCAACCTCCTGGTGTCGACCGCCCGGTCCGCCTGGTCCGGCGCCTGGCACCTCATGATGTCCCAGCTCGCGCCGTCCGACTCCGGCGGCCGCTACACCCGCCCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781847.1
MKAMSRSSTFLGSPVLLPPPAATVSRRTVKMSGTTNPITTLTRLLWGQSLPPNLLVSTARSAWSGAWHLMMSQLAPSDSGGRYTRPTSPFRLADPSSLPRHTLHLYVGLPCPWAHRTLIVRALKGLHAAVPVSVAAPGADGLWEFSAAAAETGVVAPGLDRANGCRTLKEVYNLRRGGYGGRSTVPMLWDGSSKEVVCNESYDIIELFNSGLNDVARNPDLDLAPPALKKEIDRWNKIIYPSVNNGVYRCGFAQSQEAYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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