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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000511`

染色体: Chr08 坐标: 3725235-3726700 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000511`
名称	SmilChr08G000511
描述	uncharacterized SmilChr08G000511
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3725235 - 3726700 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000104`
GeneID	`131000104`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000104`
原始查询	`LOC131000104`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0153500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0153500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=32.2; qcov=1.03; evalue=1.1e-21; confidence=low
Rice	`Os01g0153500` - identity=48.9; qcov=1.03; evalue=3.39e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000104

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781855.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057781855.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781855.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781855.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3725632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B18,C27
`Chr8:3725660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B86,B93,C39,C44
`Chr8:3725700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C31,C64
`Chr8:3725720`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A2,B20,B3,C24,C25,C64
`Chr8:3725835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3725923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B105,B140,B63,C12,C17,C43,C51,C74,C78,C82
`Chr8:3725947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:3726024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A14,B82,C19,C51
`Chr8:3726027`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C46
`Chr8:3726027`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C46
`Chr8:3726028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:3726030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781855.1

221 aa

110

221

DUF674

PF05056 DUF674 3-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781855.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	3	220	1.3e-42	146.9	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925872.1
TCGGTATCAACTCGAGTAGCTCGAGCTCGAGCTCGACTCGACTAACATCGAGTCGATTTCGAGTAATCTTCGAGCCGATCCCGAGTAGCTCGCGAGCTAGCTCGACTCACTTACACCCCTATTTCCGCTATTAGCACAATGGTAAAGTTAAAATTTTGAAATAATTTTAGTTTCCTGTGAAATGAGCTCTACAGTATGTTGAATTAGACTAGGGAAGCCTCTCCCTATCCACCCAACCCATCACAATTAATGATTCTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000104
ATGGCGGAGATGAAGGTGAGCTTGAAGCTGTTGATCGACACAGGAGCCAAGAGAGTGCTGTTCGCGGAGGCCGGCAAGGACTGCGTCGATTTCCTCTTCCACATCCTGTCTCTGCCGGTCGCCACCATCATCCGCCTGCTCCAAGCCCAAGGAATGGTGGGATCTCTCCCCAACCTCTACAAAAGCTTGGAGTCTCTCAACGACACCTACATACAGCCGGACAAGAGCAAGGACACCTTCCTCAAACCGGCGCCGCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781855.1
MAEMKVSLKLLIDTGAKRVLFAEAGKDCVDFLFHILSLPVATIIRLLQAQGMVGSLPNLYKSLESLNDTYIQPDKSKDTFLKPAPPVSSSSVPLLALKDPLIQKNFYKCAHCNCHVSDDPTAVCPKCGRKMTAIVAYVAPPAVQVASEDGGIVKGVVTYMVMDDLVVKPMSTISSITLLNKFNVKEVGALEEKVVNLGMKEAIMLLKTSLQSQKVLTDVFC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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