当前解析结果
SmilChr01G004169| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004169 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004169 |
| 描述 | probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR2 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 60184791 - 60188102 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000113 |
|---|---|
| GeneID | 131000113 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000113 |
| 原始查询 | LOC131000113 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR2 |
| 产物 | probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR2 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000113 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057781867.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057781867.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057781867.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057781867.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057781867.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:60185123 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B6,B65,C42,C87 |
Chr1:60185127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C5 |
Chr1:60185267 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B122,B7,C5 |
Chr1:60185267 |
GAA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B122,B7,C5 |
Chr1:60185315 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B106,B109,B15,B26,B9,C6,C77,C79 |
Chr1:60185362 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,B68 |
Chr1:60185506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B46,B63,C43 |
Chr1:60185528 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr1:60185536 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A3,A4,A7,B103,B119,B47,B66,B99,C31,C65,C86,D10 |
Chr1:60185541 |
AGG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A7,B106,B109,B15,B26,B9,C6,C77,C79 |
Chr1:60185575 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B57,C41 |
Chr1:60186190 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。