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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000530`

染色体: Chr08 坐标: 3860127-3861724 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000530`
名称	SmilChr08G000530
描述	cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3860127 - 3861724 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000120`
GeneID	`131000120`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000120`
原始查询	`LOC131000120`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1-like
产物	cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1-like
Arabidopsis	`AT2G27970` (CKS2) CDK-subunit 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817341] identity=89.3; qcov=0.962; evalue=3.98e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0146300` (Orysa) - identity=90.4; qcov=0.936; evalue=5.87e-46; confidence=medium
GO	GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0007346 (regulation of mitotic cell cycle); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0019901 (protein kinase binding); GO:0042393 (histone binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0061575 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity)
KEGG	-
Pfam	PF01111 (CKS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000120

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781872.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057781872.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057781872.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781872.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3860392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:3860428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781872.1

78 aa

CKS

PF01111 CKS 4-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781872.1`	Pfam	`PF01111`	CKS	Domain	4	70	7.8e-37	126.0	Cyclin-dependent kinase regulatory subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925889.1
ATTAATTTATCCCCCCTTTGCGAGACATAAATTAAACAAAATCATAGCAATTGTGAAAGCGGGAATCTTTGAGATTTGAAATTCAAATTAAAGTTCGCAAAATAAATTCATTTCATCTGGTTTAAACGGTCTATATTCTAGATAACTCTGTTTCCCGTTATTTCCAAGTGCCATAACGCTCCTTGCCCGCTCTCGCAATCGCCCCTTCATACTTAAGATCACAGTAGCAGTTATTTAGAAATCGCGTGTTTTTGTTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000120
ATGGGTCAGATTCAGTACTCTGATAAGTATGCTGATGACATCTACGAATACAGGCATGTGGTTCTTCCAGCGGAGGTCGCCAAATTGCTTCCGAAGAATCGCCTACTCTCGGAAAACGAGTGGCGAGCCCTCGGAGTTCAGCAGAGCCGTGGGTGGGTGCACTATGCTATTCATCGCCCGGAGCCACACATAATGCTATTCAGGAGGGCGCTCAACTACCAGCAGCCGCAGAATTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781872.1
MGQIQYSDKYADDIYEYRHVVLPAEVAKLLPKNRLLSENEWRALGVQQSRGWVHYAIHRPEPHIMLFRRALNYQQPQN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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