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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000544`

染色体: Chr08 坐标: 3965502-3967070 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000544`
名称	SmilChr08G000544
描述	agmatine coumaroyltransferase-2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3965502 - 3967070 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000133`
GeneID	`131000133`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000133`
原始查询	`LOC131000133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agmatine coumaroyltransferase-2-like
产物	agmatine coumaroyltransferase-2-like
Arabidopsis	`AT5G48930` (HCT) hydroxycinnamoyl-CoA shikimate/quinate hydroxycinnamoyl transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834951] identity=33; qcov=1.01; evalue=1.93e-64; confidence=low
Rice	`Os04g0664600` (AHT1) - identity=49.5; qcov=1.01; evalue=5.84e-155; confidence=high
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781888.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781889.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781888.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781888.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781888.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3965541`	`ACT`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B140,B53,B68,C59
`Chr8:3965657`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr8:3965657`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr8:3965732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B59
`Chr8:3965748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A23,B123,B18,C5
`Chr8:3965779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B4,C36,C51
`Chr8:3965782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B83,C25,C53
`Chr8:3965835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:3965848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C19,C3,C34,C49
`Chr8:3965868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B62,B75,C13,C41
`Chr8:3965892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B40,B5,B85
`Chr8:3965901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781888.1

451 aa

226

451

Transferase

PF02458 Transferase 18-445 aa

XP_057781889.1

440 aa

220

440

Transferase

PF02458 Transferase 18-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781888.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	18	445	7.6e-71	239.7	Transferase family
`XP_057781889.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	18	434	3.2e-67	227.8	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925905.1
TTGTTCTAGTATATAAATCCCTAATATGGCCTCCACTACACTCTCATCGCCTAATAAATTTCGTAAAGCAATCATGAAATTGAAAATAGCAAGTTCAAAGCTTATTAAGCCTTTGTATGTAGGCAACCCTCCTCCAACATTAACCGATTGCATCCCTTTATCTGTCTTTGATAAGGTGACCTACGATCAACATGTAGCCGTTGTTTATGCATATCGCCCTCCGACACCACCCAATGCGACGATCGAGCAAGGCCTAAGGA...

XM_057925906.1
ATATAAATCCCTAATATGGCCTCCACTACACTCTCATCGCCTAATAAATTTCGTAAAGCAATCATGAAATTGAAAATAGCAAGTTCAAAGCTTATTAAGCCTTTGTATGTAGGCAACCCTCCTCCAACATTAACCGATTGCATCCCTTTATCTGTCTTTGATAAGGTGACCTACGATCAACATGTAGCCGTTGTTTATGCATATCGCCCTCCGACACCACCCAATGCGACGATCGAGCAAGGCCTAAGGAGGGCCTTGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000133
ATGGCCTCCACTACACTCTCATCGCCTAATAAATTTCGTAAAGCAATCATGAAATTGAAAATAGCAAGTTCAAAGCTTATTAAGCCTTTGTATGTAGGCAACCCTCCTCCAACATTAACCGATTGCATCCCTTTATCTGTCTTTGATAAGGTGACCTACGATCAACATGTAGCCGTTGTTTATGCATATCGCCCTCCGACACCACCCAATGCGACGATCGAGCAAGGCCTAAGGAGGGCCTTGGCCGCGTATCGCGGGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781888.1
MASTTLSSPNKFRKAIMKLKIASSKLIKPLYVGNPPPTLTDCIPLSVFDKVTYDQHVAVVYAYRPPTPPNATIEQGLRRALAAYRGWAGRLGKDANGDPIILLNDEGVRFVEASVDRNLDQSVTFSPSTSLLSMHPALEGVVELVQVQLTRFSCGSMVVGFTAHHLVADGHATSNFLVAWGLASRGHEITSLPFNDRTIFSPRNPPRFDFQHRGAEYISRNFKKVYPLIDHDVDDIVAHKVHFTSEFLSRVKARASSMNG...

XP_057781889.1
MASTTLSSPNKFRKAIMKLKIASSKLIKPLYVGNPPPTLTDCIPLSVFDKVTYDQHVAVVYAYRPPTPPNATIEQGLRRALAAYRGWAGRLGKDANGDPIILLNDEGVRFVEASVDRNLDQSVTFSPSTSLLSMHPALEGVVELVQVQLTRFSCGSMVVGFTAHHLVADGHATSNFLVAWGLASRGHEITSLPFNDRTIFSPRNPPRFDFQHRGAEYISRNFKKVYPLIDHDVDDIVAHKVHFTSEFLSRVKPFSTFESL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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