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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000547`

染色体: Chr08 坐标: 3986024-3990023 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000547`
名称	SmilChr08G000547
描述	organellar oligopeptidase A, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3986024 - 3990023 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000136`
GeneID	`131000136`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000136`
原始查询	`LOC131000136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organellar oligopeptidase A, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	organellar oligopeptidase A%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G10540` (AT5G10540) Zincin-like metalloproteases family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830919] identity=66.6; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0830100` - identity=65.1; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0006518 (peptide metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01432 (Peptidase_M3); PF19310 (TOP_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000136

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781894.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781894.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057781894.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781894.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781894.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3986262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:3986300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B89,C27,C50,C61
`Chr8:3986876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:3987361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B10,C43,C48
`Chr8:3987950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B133
`Chr8:3987974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B36,B6,C30,C67
`Chr8:3988145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:3988260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:3988817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:3989001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B106,B35,C48
`Chr8:3989855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B18
`Chr8:3989855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781894.1

699 aa

350

699

TOP_N

Peptidase_M3

PF19310 TOP_N 29-151 aa PF01432 Peptidase_M3 232-691 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781894.1`	Pfam	`PF19310`	TOP_N	Domain	29	151	8.3e-50	168.4	Neurolysin/Thimet oligopeptidase, N-terminal domain
`XP_057781894.1`	Pfam	`PF01432`	Peptidase_M3	Family	232	691	1.1e-126	424.6	Peptidase family M3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925911.1
ACATTATAGCTTTTTCTTTGATCAATAATTTTAAAAAGTGAACATTTAATAACCCAAGATTCAACTGAAGATGAAACAACGGTCAAAGGCGGCTCCTTGTGGAAAATTAAAGGAACTCGAAACTAGATTTTGGAACTTGAATAATTCTTCCTCATATCATAGTTGATCATCATCTTCAAAATTTTGCCTTCTTCGATGGCATCAGCTGAGAATCCATTGCTGCAAGACTTCATTTTCCCGCCATACGATGTGATAGAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000136
ATGGCATCAGCTGAGAATCCATTGCTGCAAGACTTCATTTTCCCGCCATACGATGTGATAGAGCCTAATCACGTCTGCCCCGCAATTCAAACCTTGCTCATCCAACTCGAGAAGGATTTGGATGAATTGGAGAAAACAGTGGAGCCCACATGGGCAGGATTGGTTGTGCCTCTGGAGAAGATGATAGATAGGTTATCAGTTGTTTGGGGGATTGTGAATCATCTCAACTCTGTCAAGGATTGCCCTCAGCTTAGGGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781894.1
MASAENPLLQDFIFPPYDVIEPNHVCPAIQTLLIQLEKDLDELEKTVEPTWAGLVVPLEKMIDRLSVVWGIVNHLNSVKDCPQLRAAIQQVQPKKVEFQLKLRQSKLIYKAFKAIRDSLDWGKLSEARKRVVDLKLKEAVLYGVSLEDTSRERFNEIEQELEKLAQKFEENILDATKSFEKVITDKKEIEGLPLTTLTIAAEAAIVKGYENATADDGPWIITLDGPVYRSVLQHVCSRSLREEVFRAYVTRASDGPLNNT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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