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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000552`

染色体: Chr08 坐标: 4004706-4011493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000552`
名称	SmilChr08G000552
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g44820
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4004706 - 4011493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000141`
GeneID	`131000141`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000141`
原始查询	`LOC131000141`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g44820
产物	BTB/POZ domain-containing protein At3g44820
Arabidopsis	`AT3G44820` (AT3G44820) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823616] identity=62.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0130600` (P0582D05.131) - identity=44.3; qcov=0.913; evalue=3.91e-179; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000141

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057781900.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057781900.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781900.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057781900.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781900.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4008839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C65
`Chr8:4008933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B52,B74,C49
`Chr8:4009144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:4009187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr8:4009194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:4009467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B84
`Chr8:4009467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:4009859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C14,C82
`Chr8:4010618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:4010674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr8:4010718`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A25,C26,C83
`Chr8:4010718`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A25,C26,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781900.1

633 aa

316

633

BTB

NPH3

PF00651 BTB 23-112 aa PF03000 NPH3 210-470 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781900.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	23	112	2.5e-10	41.2	BTB/POZ domain
`XP_057781900.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	210	470	9.3e-87	291.7	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925917.1
TATGTGAGTGTTTTGTGAGGCAAGAATGACAAAATTTATTAATTTATCACTATTACTAGTTAACAAAATGTAATTAATATTGAAAATCTCGTCAGTTCAGGATTCAAAGCTCAGTAATATATTCCACGATTCTAAATTTTACAAAAAATAAATAAATAATTTTTTCATAAAACCTACCCCAATGTTATAATATATCAAAAAAAATACCGAAGAATGTGAATTGAATCTAATAAGACTTGTTAATTTGAAAGGGGAGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000141
ATGGCTCCTGCTGGGAGAACTTCTGGATTCCATCGTCAAGGAAATGACTGGTTCTGCAGTTCAAGTTTGCAAAGTGATATAACAGTGGTGGTGGACGACGTAAAGTTCCATCTTCACAAGTTTCCTCTCATTGCAAGATGTGGGAAGATAGCAACTATCTTTGAAGAGTCTGAAAGTTCCACTGAGACAACATTGACAGTACCGCTTGAAGAGTTTCCTGGTGGTGCCGATACGTTTCTCATTGTAGTCAAATTCTGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781900.1
MAPAGRTSGFHRQGNDWFCSSSLQSDITVVVDDVKFHLHKFPLIARCGKIATIFEESESSTETTLTVPLEEFPGGADTFLIVVKFCYGGRVELTPKNIVILYCAADYLSMTDDYDEDNLLSKSESYFHKHILKDWKGCILALQSCELVIPRADELQIISRCINALSVMICTDPSLFGWPMMMYGSLQSPGGSILWNGINTGAKIHSNESDWWFEDVSYLCVELFERLIQTMEAKGISPENLARSIMYYCKKYLPGLGRWQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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