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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000605`

染色体: Chr08 坐标: 4480505-4485556 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000605`
名称	SmilChr08G000605
描述	histone deacetylase 9
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4480505 - 4485556 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000180`
GeneID	`131000180`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000180`
原始查询	`LOC131000180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 9
产物	histone deacetylase 9
Arabidopsis	`AT3G44680` (HDA9) histone deacetylase 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823594] identity=77.3; qcov=0.939; evalue=2.54e-123; confidence=high
Rice	`Os06g0583400` (HDAC1) - identity=57.3; qcov=0.896; evalue=4.3e-77; confidence=high
GO	GO:0004407 (histone deacetylase activity); GO:0016575 (GO:0016575)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000180

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781937.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781937.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781938.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057781937.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4483327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C80
`Chr8:4484745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:4485144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B136,C26,C83
`Chr8:4485310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781937.1

430 aa

215

430

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 24-315 aa

XP_057781938.1

230 aa

115

230

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 9-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781937.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	24	315	1.6e-87	294.3	Histone deacetylase domain
`XP_057781938.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	9	115	7e-28	98.5	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925954.1
TCTTATAATAAATGTTTAGCTATAAGAAGAAGAAATCAGATGATGTCAAAGCTTTAATCTTGTACAGCTTGAAGGAGAAACGGAGCATCTCTAAAGAGAGAGCAGTTGCTGTAACTGTAATCTCCTCGCAGAACCTTATATACCCTATAGGCTATTCCGTAAACCATAATAATTTGAACAGTTCTTGATTCTGGAGCCGATTAGGGTTTAGGTTTTCGCAAGTAATCACTTCGCATTTCTTCTTCATTTGCGCCGGCGGC...

XM_057925955.1
GAGGCATCTGGGTTTTGTTACATCAATGACCTTGTGTTGGGAATTCTGGAGCTCTTGAAGTACCATGCTCGTGTGTTATATATTGATATTGATGTGCATCATGGTGATGGGGTTGAAGAAGCCTTTTATTTCACTGATAGGGTGATGACAGTTAGTTTCCACAAGTATGGTGACTTGTTCTTTCCTGGAACAGGATGTTGGAGAAAAAGAAGGCAAAAATTATGCCATAAATGTACCTCTTAGGGATGGAATAGATGACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000180
ATGCGCAGCAAGGACAGAATTTCCTATTTTTATGACGGGGATGTGGGAAACGTTTACTTCGGGCCTAATCACCCAATGAAGCCGCACCGTTTGTGCATGACGCACCATTTGGTTCTGGCGTATGAGCTTCACAACAAGATGGAAATTTATAGGCCTCACAAGGCGTATCCTGTGGAGCTAGCACAGTTCCATTCTCCGGATTATGTGGAGTTTCTGCAGCGAATCACTCCCGACAAGCAAGTACTCTTCGCTAATGAAAT...

LOC131000180
ATGGTGACTTGTTCTTTCCTGGAACAGGATGTTGGAGAAAAAGAAGGCAAAAATTATGCCATAAATGTACCTCTTAGGGATGGAATAGATGACGGGAGCTTCTTACGTCTCTTTAAAACGATCATTTTGAAAGTTGTCGAGTGCTATGCTCCTGGAGCTATTGTTCTCCAATGTGGAGCAGATTCACTTGCTGGGGACAGATTGGGATGCTTCAACCTTTCTATTGATGGTCATGCAGCTTGTGTGAAGTTTGTCAAGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781937.1
MRSKDRISYFYDGDVGNVYFGPNHPMKPHRLCMTHHLVLAYELHNKMEIYRPHKAYPVELAQFHSPDYVEFLQRITPDKQVLFANEMAKYNLGEDCPVFENLFEFCQIYAGGTLDAARRLNNRLCDIAINWAGGLHHAKKCEASGFCYINDLVLGILELLKYHARVLYIDIDVHHGDGVEEAFYFTDRVMTVSFHKYGDLFFPGTGDVKDVGEKEGKNYAINVPLRDGIDDGSFLRLFKTIILKVVECYAPGAIVLQCGA...

XP_057781938.1
MVTCSFLEQDVGEKEGKNYAINVPLRDGIDDGSFLRLFKTIILKVVECYAPGAIVLQCGADSLAGDRLGCFNLSIDGHAACVKFVKQLNLPLLVTGGGGYTKENVARCWTVETGALLGVELASEIPENEYFKYFAPDYSLKCASGHMENLNSKSYLNNIRQQVCENLSAIQHAPGVQMQEVPPDFYIPDFDEDEQNPDERVNRHMQDKQVQRDDEYYEGDNDNDQNNDDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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