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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000610`

染色体: Chr08 坐标: 4542446-4549654 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000610`
名称	SmilChr08G000610
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP71
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4542446 - 4549654 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000185`
GeneID	`131000185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000185`
原始查询	`LOC131000185`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP71
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP71
Arabidopsis	`AT3G44600` (CYP71) cyclophilin71 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823585] identity=82.7; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0557500` (OsCYP71) - identity=84.1; qcov=0.861; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase); PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781949.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781950.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057781949.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781949.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4542673`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A11,A18,A21,A22,B130,B131,B133,B16,B19,B35,B37,B6,B69,B7,B78,B9,C1,C10,C17,C2,C20,C26,C45,C46,C49,C63,D4,D8
`Chr8:4542746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:4542749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A19,B33,B49,B77,C32,C68,C73,D6
`Chr8:4542770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr8:4542776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B114,B133,C45
`Chr8:4542778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C12
`Chr8:4542978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:4543009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B47,D7
`Chr8:4543011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B45,C25,C34,C67
`Chr8:4543691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C69
`Chr8:4543704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:4544241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B131,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781949.1

617 aa

308

617

WD40

Pro_isomerase

PF00400 WD40 56-83 aa PF00400 WD40 94-128 aa PF00160 Pro_isomerase 465-614 aa

XP_057781950.1

511 aa

256

511

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 359-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781949.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	56	83	1.9e-12	47.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781949.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	94	128	1.9e-12	47.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781949.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	465	614	1.1e-55	189.0	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057781950.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	359	508	9.6e-56	189.1	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925966.1
ATATACACAATTTCAAATGTACAAAAAGATTAGTATTCCAAACCCCCAAAAAATTGTCCCTCAACACTAGCGTAGTAGTGAAATTCTATAACCCAAATTAAATCTTGAAGAAATCCACATATTTTGCCTAAAAGATTAAACCTTTGTAGCGCGGACGAATTCGAATCCAACTCCGTTGCTAGTAATCTCGAAGAGAAGAGAATGGAAGCCGCTCAGAATGACAACGGTGACTCCGCCGCCGCTGAGGAAGAGCCCATGGT...

XM_057925967.1
TTATATGCACCGCGATGTGGTTACGCATGTAGCTGTTTCGGCGGCTGAATTTTTCATAACTGGGAGTGCGGATGGTTAGTGTAGATGGTGCTCTTTGTTGTACAATTTCAAATGACCGCTCTGTGAAAATATATGATGTATTTAACTATGATATGATGGCTATGATACGTCTTCCTTTTGTGGCCGGTTGCATTGAATGGGTTTACAAACAAGGGGATGTAAAGGCAAAACTAGCAATTAGTGATCGTGACTCTCCCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000185
ATGGAAGCCGCTCAGAATGACAACGGTGACTCCGCCGCCGCTGAGGAAGAGCCCATGGTTGGGCCCGGCCCGGCGCCTCGCGCCCGACCCAAACGCCCTCTGCAGTTCGAACAGGCCTATCTCGATTCGCTCCCCTCCGCCAACATGTATGAGAAGAGTTATATGCACCGCGATGTGGTTACGCATGTAGCTGTTTCGGCGGCTGAATTTTTCATAACTGGGAGTGCGGATGGCCATATAAAGTTTTGGAAGAAAAAAGC...

LOC131000185
ATGGTTAGTGTAGATGGTGCTCTTTGTTGTACAATTTCAAATGACCGCTCTGTGAAAATATATGATGTATTTAACTATGATATGATGGCTATGATACGTCTTCCTTTTGTGGCCGGTTGCATTGAATGGGTTTACAAACAAGGGGATGTAAAGGCAAAACTAGCAATTAGTGATCGTGACTCTCCCTCTGTTCACATATATGATGCTCGATCGGGCTCAAATGATTCCATTTTATCTAGAGAGATACACCTTGGACCGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781949.1
MEAAQNDNGDSAAAEEEPMVGPGPAPRARPKRPLQFEQAYLDSLPSANMYEKSYMHRDVVTHVAVSAAEFFITGSADGHIKFWKKKATGIEFAKHFRSHLGPIEGLAVSVDGALCCTISNDRSVKIYDVFNYDMMAMIRLPFVAGCIEWVYKQGDVKAKLAISDRDSPSVHIYDARSGSNDSILSREIHLGPIKSMKYNHEYDTAISADDKGVIEYWSPATLQFPETGVNFRLKSDTDLFAIVKAKTAVSSIEVSPDGKQ...

XP_057781950.1
MVSVDGALCCTISNDRSVKIYDVFNYDMMAMIRLPFVAGCIEWVYKQGDVKAKLAISDRDSPSVHIYDARSGSNDSILSREIHLGPIKSMKYNHEYDTAISADDKGVIEYWSPATLQFPETGVNFRLKSDTDLFAIVKAKTAVSSIEVSPDGKQFSITSPDRRIRVFWFRTGKLRRVYDESLEVAQDLQRKDVPLYRLEAIDFGRRMAVEREIEKTENVPQPNAVFDESSNFLIYATLLGIKVVNLHTNRVSRILGKVEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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