当前解析结果
SmilChr08G000613| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000613 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000613 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000613 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 4561614 - 4563476 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000191 |
|---|---|
| GeneID | 131000191 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000191 |
| 原始查询 | LOC131000191 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000191 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057781957.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057781957.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057781957.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057781957.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057781957.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:4561922 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A7 |
Chr8:4561923 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr8:4561928 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B49,D11 |
Chr8:4561930 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,C58 |
Chr8:4561931 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 46 | A11,A4,A7,B100,B106,B109,B11,B112,B115,B12,B125,B127,B14,B20,B22,B23,B30,B32,B41,B46,B48,B50,B57,B62,B69,B72,B73,B75,B79,B91,B93,B97,B99,C1,C11,C14,C34,C41,C42,C52,C58,C61,C69,C72,C82,D9 |
Chr8:4562039 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B20,B49,D11 |
Chr8:4562161 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr8:4562202 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B131 |
Chr8:4562202 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:4562209 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B71,B81,B89,C62 |
Chr8:4562250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,B13,C27,C74,D2 |
Chr8:4562260 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,B13,B67,C74,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。