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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000620`

染色体: Chr08 坐标: 4636923-4639260 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000620`
名称	SmilChr08G000620
描述	zinc finger protein WIP3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4636923 - 4639260 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000197`
GeneID	`131000197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000197`
原始查询	`LOC131000197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein WIP3-like
产物	zinc finger protein WIP3-like
Arabidopsis	`AT1G08290` (WIP3) WIP domain protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837349] identity=56.4; qcov=1; evalue=1.77e-116; confidence=high
Rice	`Os06g0612300` - identity=85.1; qcov=0.478; evalue=1.54e-101; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010468 (regulation of gene expression); GO:0048856 (anatomical structure development)
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2); PF22995 (C2CH-3rd_BIRD-IDD); PF23115 (zf-C2H2_STOP2_3rd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781963.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781963.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781963.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781963.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4637305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B136
`Chr8:4637317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:4637319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:4637350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:4637359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4637461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr8:4637542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:4637554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B32,B98,C19
`Chr8:4637620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:4637622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4639040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781963.1

322 aa

161

322

zf-C2H2

zf-C2H2_STOP2_3rd

C2CH-3rd_BIRD-IDD

PF00096 zf-C2H2 166-185 aa PF23115 zf-C2H2_STOP2_3rd 212-246 aa PF22995 C2CH-3rd_BIRD-IDD 250-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781963.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	166	185	5.1e-07	30.5	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057781963.1`	Pfam	`PF23115`	zf-C2H2_STOP2_3rd	Domain	212	246	2.4e-18	66.6	STOP2-like, C2H2-type zinc finger
`XP_057781963.1`	Pfam	`PF22995`	C2CH-3rd_BIRD-IDD	Domain	250	274	9.5e-11	41.9	BIRD-IDD transcription factor, third C2HC zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925980.1
AAAATTCAATATTTGATTCAAGCTTTCCCACACAAAGTCCAACTATAATAATCCCATCCTGATCGGAAAAAGAATTGAAATAATAAAATTCTGTCGTAGTATGATGAGCACGAAATGTTGAAGAATATAAATTTGTGGTTCGATATTACTCGAAATTCCATTGAATGGCTCAAGCCATTTCCCTCTCCATCACCACCGCCTTCATCCTCTTCAACTCAAAGCCACTCCAAAAAAGCCATGAATTTCTTCGAGTTCCCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000197
ATGTTGAAGAATATAAATTTGTGGTTCGATATTACTCGAAATTCCATTGAATGGCTCAAGCCATTTCCCTCTCCATCACCACCGCCTTCATCCTCTTCAACTCAAAGCCACTCCAAAAAAGCCATGAATTTCTTCGAGTTCCCACTCTTCAACGATGAGAATCACGACGAAGAGGGAGAAAGTTACGTGTACGAGACGATCCAGTGTTTGCCGCTTCTCAGCAGGTTCGCGGCGGAGAAGAAGGAGGTGAAGGAAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781963.1
MLKNINLWFDITRNSIEWLKPFPSPSPPPSSSSTQSHSKKAMNFFEFPLFNDENHDEEGESYVYETIQCLPLLSRFAAEKKEVKEEEDDGRLNENVAVALHIGLPDIGEIDVDRDDEEEEEEEEYSMKTKTKTQMKMKMKMKSSSNGERRFWIPTPAQILVGPMQFSCNICSKTFNRYNNMQMHMWGHGSEFRKGPESLRGTQPAAMLRLPCYCCAAGCKNNVNHPRAKPLKDFRTLQTHYKRKHGAKPFACRKSCGKSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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