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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000639`

染色体: Chr08 坐标: 4754735-4761121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000639`
名称	SmilChr08G000639
描述	uncharacterized SmilChr08G000639
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4754735 - 4761121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000215`
GeneID	`131000215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000215`
原始查询	`LOC131000215`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781987.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781987.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781987.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781987.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781987.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4757250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A22,A4,A5,A6,B101,B106,B118,B120,B123,B139,B38,B42,B50,B67,B8,B81,B87,C14,C16,C26,C29,C3,C36,C39,C4,C41,C63,C70,C75
`Chr8:4757295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C17
`Chr8:4757316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C17
`Chr8:4757317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:4757443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C46
`Chr8:4757454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:4757458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:4757473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B140,D5
`Chr8:4757479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:4757481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C41
`Chr8:4757501`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B133,B35,C17
`Chr8:4757501`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B133,B35,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781987.1

553 aa

276

553

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 120-233 aa PF13952 DUF4216 399-472 aa

XP_057781988.1

384 aa

192

384

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 165-297 aa

XP_057781989.1

384 aa

192

384

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 165-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781987.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	120	233	3.8e-43	146.7	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057781987.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	399	472	1.4e-19	71.1	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057781988.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	165	297	3.4e-14	53.9	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057781989.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	165	297	3.4e-14	53.9	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926006.1
GTCCGACGCGACGCGACCGCTGCTGCTCCTCTCCGTCCGACGCGCCGCCGCCGCCGCTCTCCGTCCGACGCCGCTGCTCTCCGTCGACGTGATACTCTACGCCCCCTGCCCTCGCCGGACCGCCCCTGCCCTCGCCGGAAAGCTCCTGCCGTTGCCGGAATAAGAGATTGTAGATGGATGCTTCTACTCAATCCGGGTCTAATCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCG...

XM_057926005.1
CGAATATAGATGACATTTCAACAATGGTTCATCCACATGGAGGCGAGGTGGACATAGATCATGATGATGATGATGATGAAGATGATGAAGACCTTATTTTACAATCCCCCGAGTCTTCTAACACTGAATCAGATTGAATGGATGCTTCTACTCAATCCGGGTCTAATCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTGGTCCTATTTTCGATAATAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000215
ATGGATGCTTCTACTCAATCCGGGTCTAATCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTGGTCCTATTTTCGATAATAGGCCGCCAGTGGATGAAAACCCTAATGTGGAGGAGGAACGTGTTGCTAGTGATGGGCGGACATGGGTTTATTTCACTCGTAGTATTCTGAGGCCGACTGGAGCTATTCGGGCTAGGGCGACTGATAGCTTTCAAGGTAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057781987.1
MNTKGKTKDTAKSREELNRFCRRPELEANEQTGKYPKACYMLDNDEKRILLKWIEGLRFPDGYVSSLGRCVNLSTLQMFGMKSHDCHVMMQRVLPVALKDLLPFNVWKTITDLCLFFKDLTSPNIQVDNLLQMQKNIPVILCKLERIFPPSFFDSMEHLPIHLADEAMMAGPVQYRWMYPFERYLGKLKKTVKNKAKVEGSITNAYLVEEATAFCCYYFEDHVKTKQRNVPRNFEGSGVDVIPDMLSVFKYVGRPFGKMT...

XP_057781988.1
MDASTQSGSNPSGSTPSGSGPSGSTPSGSGPSGSGPIFDNRPPVDENPNVEEERVASDGRTWVYFTRSILRPTGAIRARATDSFQGMPHESGTNWKNLTEGMRDFYFDEFEKAFCWDKTQHTRHVIKKAWVKSARVAYKDYISNCKKVLLIHKKKIEYLQPNIEAAWRAYWALPATQARSAQASRNRRSEPGGPGTGMAIHHGGSRSALYHAEHLARESNISFDEATWATFRRMHYKNGQYTAGRPAQHGLEVERRLAEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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