当前解析结果
SmilChr08G000642| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000642 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000642 |
| 描述 | mitochondrial fission protein ELM1 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 4788747 - 4795203 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000218 |
|---|---|
| GeneID | 131000218 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000218 |
| 原始查询 | LOC131000218 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial fission protein ELM1 |
| 产物 | mitochondrial fission protein ELM1 |
| Arabidopsis | AT5G22350 (ELM1)fission ELM1-like protein (DUF1022) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832295] identity=69; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0535700- identity=58.9; qcov=0.671; evalue=3.05e-112; confidence=high |
| GO | GO:0000266 (mitochondrial fission); GO:0005741 (mitochondrial outer membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06258 (Mito_fiss_Elm1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000218 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057781996.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.40000 | XP_057781996.1 |
| 3 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057781996.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057781996.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057781996.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:4789368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr8:4790565 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,B93 |
Chr8:4790715 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,C10,D11,D7 |
Chr8:4791677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr8:4792585 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr8:4792817 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr8:4794079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B11,B16,C9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057781996.1PF06258
Mito_fiss_Elm1 44-419 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057781996.1 |
Pfam | PF06258 |
Mito_fiss_Elm1 | Family | 44 | 419 | 3e-108 | 362.3 | Mitochondrial fission ELM1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。