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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000645`

染色体: Chr08 坐标: 4804574-4807646 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000645`
名称	SmilChr08G000645
描述	uncharacterized SmilChr08G000645
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4804574 - 4807646 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000221`
GeneID	`131000221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000221`
原始查询	`LOC131000221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0966400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0966400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G22320` (AT5G22320) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832292] identity=60.7; qcov=0.588; evalue=6.07e-105; confidence=medium
Rice	`Os01g0966400` - identity=68.3; qcov=0.523; evalue=2.71e-109; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781999.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057781999.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057781999.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781999.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4804754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D11
`Chr8:4804896`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B87,C84,D9
`Chr8:4804896`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B87,C84,D9
`Chr8:4805040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:4805107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B6,C1,C80
`Chr8:4805630`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:4806172`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A19,B55,D2
`Chr8:4806172`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A19,B55,D2
`Chr8:4806182`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A19,B55,D2
`Chr8:4806182`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A19,B55,D2
`Chr8:4806189`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A19,B55,D2
`Chr8:4806189`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A19,B55,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781999.1

459 aa

230

459

LRR_8

LRR_1

LRR_4

PF13855 LRR_8 176-235 aa PF00560 LRR_1 177-197 aa PF12799 LRR_4 177-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781999.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	176	235	2.6e-18	66.3	Leucine rich repeat
`XP_057781999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	177	197	8.3e-07	28.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057781999.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	177	217	8.2e-23	80.6	Leucine Rich repeats (2 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926016.1
TACTAGTAATAATTTATATATGCGCCCTCAGGTCTCAGCAGACAACAGCCAGCCCTTGTAACCTAAAACTGTCACTTATTTAGGGTTTTTGCAGAGTGCACCAAAGCCCTAATTGAAACTCTATCAAACAATGGCAGCGCTGAGCTCCAAGAAAATTTTGGAAGAACAGAACGCAAATGACCCCAACTCAATTACCTCTCTTACTCTTACTCATAAAGCCCTCACTGATGTTTCATGTTTGGGTGTATTCAAGAATCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000221
ATGGCAGCGCTGAGCTCCAAGAAAATTTTGGAAGAACAGAACGCAAATGACCCCAACTCAATTACCTCTCTTACTCTTACTCATAAAGCCCTCACTGATGTTTCATGTTTGGGTGTATTCAAGAATCTGGAAAGATTGGATCTTGGGTTCAATAACTTGACTTCGCTTGAGGGTTTAAAGTCATGTACGAATTTGAAGTGGTTATCAGTTGTGCAGAATAAGCTTGAGAGCTTGAAGGGCATTGATGCCCTAAATAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781999.1
MAALSSKKILEEQNANDPNSITSLTLTHKALTDVSCLGVFKNLERLDLGFNNLTSLEGLKSCTNLKWLSVVQNKLESLKGIDALNKLTVLNAGKNKLKSMDDVKSLTSLRALILNDNEISSVCKLDQMKELNTLVLSRNPINSLGESLVKLKSITKLSLSNCQLQKVDSSLRSCLELKELRLAHNEIMTIPDELGRLVKLQNLDLGNNLIARWSNLKVLSSLVNLTNLNLQGNPIAEKENLLKKVKKLLPNLHVFNARPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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