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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000667`

染色体: Chr08 坐标: 4926567-4933406 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000667`
名称	SmilChr08G000667
描述	serine/threonine-protein kinase Nek5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4926567 - 4933406 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000242`
GeneID	`131000242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000242`
原始查询	`LOC131000242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase Nek5-like
产物	serine/threonine-protein kinase Nek5-like
Arabidopsis	`AT3G44200` (NEK6) serine/threonine-protein kinase NEK5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823542] identity=60.9; qcov=0.612; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0440800` (OsNek4) - identity=60; qcov=0.516; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007017 (microtubule-based process); GO:0055028 (cortical microtubule)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782024.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057782024.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782024.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782024.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4926939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:4927054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4927087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B61,B75
`Chr8:4927141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B31,C71
`Chr8:4927205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B24,B66
`Chr8:4927208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B18,B55,B65,C24
`Chr8:4927237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr8:4927293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,D10
`Chr8:4927343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:4927351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:4927411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B31,B94,C71,C82
`Chr8:4927426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B31,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782024.1

1007 aa

504

1007

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 8-262 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 9-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782024.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	8	262	1.6e-64	218.6	Protein kinase domain
`XP_057782024.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	9	258	9.5e-40	137.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926041.1
GATCAAGAAAATACTTAAAAATAATCCCGACAGAGAGAGAGAGAGAGAACAAAAGAAAAAAAAACACAGAAAACTCCAGCTTTCTTTGGTTAATACCCATTAAAAAAGCTCCAATTTTTGGATTGCCCAGAAGGCCAAATTGGTTAAATTTCATTTATTGCTTCAGCTCCAAGTACTTGGTGCTCATTATCGTGTATGTATTTGCTGTTTGCGGAGTTTAATAATGTGTGCGTTCGTTGGGATTGATATGCTCATGGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000242
ATGGAATCAAAAATGGATCAGTATGAGCTCATGGAGCAGATTGGCCGCGGAGCTTTTGGTGCTGCCATTTTAGTCAATCACAAATTGGAAAGGAAAAAGTATGTGCTCAAGAAGATTCGGTTAGCTCGGCAAACGGAGCGTTGCCGGAGATCAGCTCATCAAGAGATGGCTTTAATTGCACGGATACAACATCCATACATTGTTGAGTTCAAGGAAGCTTGGGTAGAGAAGGGTTGTTATGTCTGCATTGTTACTGGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782024.1
MESKMDQYELMEQIGRGAFGAAILVNHKLERKKYVLKKIRLARQTERCRRSAHQEMALIARIQHPYIVEFKEAWVEKGCYVCIVTGYCEGGDMAEMMKKANGQYFPEEKLLKWFAQLLLAVEYLHSNYVLHRDLKCSNIFLTKDQGVRLGDFGLAKTLKADDLASSVVGTPNYMCPELLADIPYGFKSDIWSLGCCMYEMAAHRPAFKAFDMAGLISKINRSSIGPLPPCYSPSLKTLIKSMLRKNPEHRSSASELLRHP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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