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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000670`

染色体: Chr08 坐标: 4968531-4971059 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000670`
名称	SmilChr08G000670
描述	histone deacetylase 8
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4968531 - 4971059 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000246`
GeneID	`131000246`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000246`
原始查询	`LOC131000246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 8
产物	histone deacetylase 8
Arabidopsis	`AT1G08460` (HDA08) histone deacetylase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837366] identity=70.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0440250` - identity=73.3; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000246

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782030.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782030.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057782030.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057782030.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4968767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4968811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B19,B65,C24
`Chr8:4968862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B73,C12,C75
`Chr8:4968938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B55
`Chr8:4969015`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B122,B134,B140,B53,B61,B97,B99,C24
`Chr8:4969037`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B134,B30,B53,B61,B63,B64,C24
`Chr8:4969038`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B101,B140,B97,B99
`Chr8:4969038`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B101,B140,B97,B99
`Chr8:4969367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4969417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B67,B93,C10
`Chr8:4969418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B59
`Chr8:4969451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782030.1

374 aa

187

374

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 39-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782030.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	39	330	1.2e-80	271.8	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926047.1
AGTGAGTAGATTCCACGAAAATTCATTTTATATACCAAGACTTTGAGAAGAAAAATAAGTGGGCCGTGAAAATTGTGTCGCAGCGATCGAGAAGTGTAGCCGCAGCCACACACAAATCCAAGACTTAATAATGGCGGATGAAGTGATCCACGTATTCTGGGAGGAAGGAATGCTGAGGCATGATGCGGGTCGGGGCGTATTCGACTCGGGTTTGGATCCGGGATTCCTGGATGTGCTGGAAGCCCACCCGGAGAACGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000246
ATGGCGGATGAAGTGATCCACGTATTCTGGGAGGAAGGAATGCTGAGGCATGATGCGGGTCGGGGCGTATTCGACTCGGGTTTGGATCCGGGATTCCTGGATGTGCTGGAAGCCCACCCGGAGAACGCGGGGCGGGTCAAGAACATGGTTTCCATCCTCAAACGGGGCCCCATCGCCCCATTTCTCTCTTGGCATCAAGGCCGTCGCGCCCTCATCTCCGAATTGCTCTCTTTCCACACCCAAGAATATATAGATGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782030.1
MADEVIHVFWEEGMLRHDAGRGVFDSGLDPGFLDVLEAHPENAGRVKNMVSILKRGPIAPFLSWHQGRRALISELLSFHTQEYIDELVEADRSGGKDFGGGTFLNPGSWDSALLAAGTTLSAMKHILDGNGKVSYALVRPPGHHAQPTRADGYCFLNNAGLAVELALSSGVSKVAVIDIDVHYGNGTAEGFYRSNRVLTISLHMNHGSWGPSHPQDGTVGELGEGEGYGYNLNIPLPNGSGNRGYAHAVTELVVPAIERF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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