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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000680`

染色体: Chr08 坐标: 5056418-5060796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000680`
名称	SmilChr08G000680
描述	dnaJ protein homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5056418 - 5060796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000256`
GeneID	`131000256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000256`
原始查询	`LOC131000256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein homolog
产物	dnaJ protein homolog
Arabidopsis	`AT5G22060` (J2) DNAJ homologue 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832267] identity=80.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0787300` (OsDjA5) - identity=85; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0009408 (response to heat); GO:0030544 (Hsp70 protein binding); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF00684 (DnaJ_CXXCXGXG); PF01556 (DnaJ_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782043.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782043.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782043.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057782043.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5056967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C58
`Chr8:5057054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:5057275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:5057282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B69,B8,C54
`Chr8:5057685`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A2,A4,B101,B108,B12,B122,B16,B18,B30,B36,B48,B62,B65,B84,B88,B89,B94,B99,C16,C22,C34,C46,C54,C56,C59,C61,C64,C81,D1,D2,D6,D7
`Chr8:5057700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:5057841`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A2,A4,B101,B117,B118,B12,B122,B13,B16,B18,B30,B33,B36,B47,B48,B62,B65,B78,B82,B84,B86,B87,B88,B89,B94,B96,B99,C16,C22,C34,C4,C46,C48,C54,C56,C59,C61,C64,C70,C75,C81,D1,D2,D6,D7
`Chr8:5057938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B35,B75,C28,C34
`Chr8:5058169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr8:5060465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B129
`Chr8:5060541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr8:5060578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B19,B33,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782043.1

418 aa

209

418

DnaJ

DnaJ_C

DnaJ_CXXCXGXG

PF00226 DnaJ 13-71 aa PF01556 DnaJ_C 122-343 aa PF00684 DnaJ_CXXCXGXG 148-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782043.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	13	71	7.1e-23	81.2	DnaJ domain
`XP_057782043.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	122	343	1.7e-36	126.3	DnaJ C terminal domain
`XP_057782043.1`	Pfam	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	Domain	148	214	5.8e-16	59.2	DnaJ central domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926060.1
GGGTTTGTTGAATGATTGAACGGCCCAGATGGTGTATGACAGTGTGAGCACATCTCCACCGCCAATGAAGTAGTACATATACGAAGAAACCCCTTCAAAGTCTCCTCTCTAGCTGCCTTGCTATCTCTCTCGCTATCGCTTCTATACGTACAGCCTATACGTATAGTCGTCGATCTCTGCGATTTTGATCGGAAAAGGTGAGCAAACATGTTTGGGAGGGCGCCCAAGAAAAGTGATAACACCAAGTACTATGAGGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000256
ATGTTTGGGAGGGCGCCCAAGAAAAGTGATAACACCAAGTACTATGAGGTTCTCGGCGTCCCCAAAACGGCGTCGCCCGATGATCTCAAGAAGGCCTACAAGAAAGCAGCCATCAAGAACCATCCCGACAAAGGCGGCGATCCTGAGAAGTTCAAGGAGCTTGCTCATGCTTATGAGGTCCTAAGTGATCCTGAAAAACGTGAAATCTATGACCAATATGGTGAAGATGCACTCAAGGAAGGAATGGGTGGGGGTGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782043.1
MFGRAPKKSDNTKYYEVLGVPKTASPDDLKKAYKKAAIKNHPDKGGDPEKFKELAHAYEVLSDPEKREIYDQYGEDALKEGMGGGGDMHDPFDIFSSFFGGSSFGGGGSSRGRRQRRGEDVVHPLKVSLEDLYLGTSKKLSLSRNVLCSKCKGKGSKSGASTKCSGCQGQGMKVSIRQLGPGMIQQMQHPCNQCKGTGETISDRDRCPQCKGEKVVQEKKVLEVHVEKGMQNGQKVTFPGEADEAPDMVTGDIVFVLQQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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