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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000685`

染色体: Chr08 坐标: 5087462-5092941 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000685`
名称	SmilChr08G000685
描述	outer envelope protein 39, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5087462 - 5092941 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000262`
GeneID	`131000262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000262`
原始查询	`LOC131000262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	outer envelope protein 39, chloroplastic
产物	outer envelope protein 39%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G44160` (AT3G44160) Outer membrane OMP85 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823537] identity=75.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0510200` - identity=61.2; qcov=0.992; evalue=8.74e-173; confidence=high
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy); GO:0019867 (outer membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01103 (Omp85)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057782054.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057782054.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057782054.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782054.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5087753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr8:5087796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B44
`Chr8:5089932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:5090063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:5092159`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr8:5092159`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr8:5092578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782054.1

361 aa

180

361

Omp85

PF01103 Omp85 55-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782054.1`	Pfam	`PF01103`	Omp85	Domain	55	354	3.2e-27	96.6	Omp85 superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926071.1
TGCTTTTTCAATCCCCTCCTCTCAAAGCAAGAGATAACTTCCCCACAACTGCCTTCTTGTCTTCCCCTTTAACAAATCACTCCCAACGCCTTTAAATAACGGCCACTTTCTCACACCAACATTTCTCGATTTTTTTTTCCCACTTAAATGGTGGTGCAGAGCTATCAAGAATTCAGCTTGATTGGCGGAGAGGGACAAAATCCCGTGATATGGTAATTGGATGGGAGCACAGAAAAGCATTCACGCCGGCAATGCCAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000262
ATGGGAGCACAGAAAAGCATTCACGCCGGCAATGCCAAGGTAGAGTTCAATGTCGATTTCACACACAAACTATGTGCTGCTTTGATGCTGCCTTCTCTCAGAAATGCTGGTGGATGGAGTCCACTGTCACTTGTTATTGGGAGCCTCTGCATAAAGCATCCAAATCTATTTGGAAAGAGCGAGAAGCTTGATTTATTGTGGGATAAAGGGCTCTGTGATTCCAATGTTTTGATTACTTATCGGAAGCCAAGACCAGAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782054.1
MGAQKSIHAGNAKVEFNVDFTHKLCAALMLPSLRNAGGWSPLSLVIGSLCIKHPNLFGKSEKLDLLWDKGLCDSNVLITYRKPRPEWLSQHAFIIQHSISPEIGIHGIPVDNLSRSASGGVNLCRLSAGVDLSEPASSNWSSKTSIKFEHVRPVNDDGRSISRDLHGFPVTCSGGYHDSMVVLKQESRFAKATDCSFTRFSLQIEQGIPILSKWLIFNRFKFAASRGIRLGPAFFLTSLTGGSIVGDIAPYQAFSIGGQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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