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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000707`

染色体: Chr08 坐标: 5245863-5258888 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000707`
名称	SmilChr08G000707
描述	structural maintenance of chromosomes protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5245863 - 5258888 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000300`
GeneID	`131000300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000300`
原始查询	`LOC131000300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes protein 3-like
产物	structural maintenance of chromosomes protein 3-like
Arabidopsis	`AT2G27170` (TTN7) Structural maintenance of chromosomes (SMC) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817259] identity=67.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0133300` (SMC3) - identity=82.4; qcov=0.213; evalue=4.14e-144; confidence=weak
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005694 (chromosome); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0061775 (cohesin loader activity)
KEGG	-
Pfam	PF02463 (SMC_N); PF06470 (SMC_hinge); PF13304 (AAA_21); PF13476 (AAA_23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782126.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057782126.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057782126.1`
4	Centromere	着丝粒	0.60000	`XP_057782126.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5246905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B97,C48,C72
`Chr8:5246911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5250088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,C87
`Chr8:5251758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C25,C61
`Chr8:5254059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5254094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B78,B89,C75
`Chr8:5254477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:5255277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:5255722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B74,C25,C61
`Chr8:5256064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5256115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B88
`Chr8:5256505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782126.1

1204 aa

602

1204

SMC_N

AAA_23

SMC_hinge

SMC_N

AAA_21

PF02463 SMC_N 2-133 aa PF13476 AAA_23 6-313 aa PF06470 SMC_hinge 523-633 aa PF02463 SMC_N 873-1181 aa PF13304 AAA_21 1050-1160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782126.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	2	133	3e-54	184.5	RecF/RecN/SMC N terminal domain
`XP_057782126.1`	Pfam	`PF13476`	AAA_23	Domain	6	313	3.9e-09	38.2	AAA domain
`XP_057782126.1`	Pfam	`PF06470`	SMC_hinge	Domain	523	633	5.6e-31	108.0	SMC proteins Flexible Hinge Domain
`XP_057782126.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	873	1181	3e-54	184.5	RecF/RecN/SMC N terminal domain
`XP_057782126.1`	Pfam	`PF13304`	AAA_21	Domain	1050	1160	5.9e-16	60.0	AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926143.1
TACAAAATGAAACCATTGTTGGCGTGGAGTCAATTCCCTCCATTTCCATCTTTTCTTCCATCTCTCCTTTTCTCTCCCCTCTCTCTCGCACCTACGCTCACCTCACTGGGTAGACTACACACATAGCTCAACATCACCGCCTTCCACCGCTCACTGGGAGCCGGATTTAAACATTTTGCAGCTACTCGCTCAATTTGGAGAGCAGTCTCAAACTGCACTGAATCTCGTCATGTATATAAAGCAGGTTGTAATAGAAGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000300
ATGTATATAAAGCAGGTTGTAATAGAAGGGTTTAAGAGTTACAGGGAACAGATTTCAACTGAAACATTCAGTCCCAAAGTTAACTGTGTTGTTGGTGCTAATGGATCCGGTAAATCTAACTTCTTCCACGCAATACGCTTTGTGATAAGTGATCTATTTCATAACTTGCGTAATGAAGAAAGGCAAGCATTGCTTCATGAAGGTGCAGGCCACCAGGTGTTATCAGCGTTTGTGGAGATCGTCTTTGACAACTCGGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782126.1
MYIKQVVIEGFKSYREQISTETFSPKVNCVVGANGSGKSNFFHAIRFVISDLFHNLRNEERQALLHEGAGHQVLSAFVEIVFDNSDNRIPVDKEEVRLRRTIGVKKDEYFLDGKHITKTEVMNLLESAGFSRSNPYYVVQQGKIASLTLMKDSERLDLLKEIGGTRVYEERRRESLKIMQETGNKRKQIIQVVQYLDDRLRELDEEKEELKKYQQLDRQRKSLEYTIYDKELHDAKQQLAKIDEDRYRVSEKSATMYNSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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