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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000726`

染色体: Chr08 坐标: 5389767-5391715 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000726`
名称	SmilChr08G000726
描述	double-stranded RNA-binding protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5389767 - 5391715 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000304`
GeneID	`131000304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000304`
原始查询	`LOC131000304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	double-stranded RNA-binding protein 1-like
产物	double-stranded RNA-binding protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G41070` (DRB5) dsRNA-binding protein 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834109] identity=34.4; qcov=0.526; evalue=6.04e-19; confidence=low
Rice	`Os01g0772000` (OsDRB4) - identity=35.6; qcov=0.816; evalue=1.53e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00035 (dsrm); PF14709 (DND1_DSRM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782132.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782132.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057782132.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782132.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5390135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:5390153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C9
`Chr8:5390167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B34,B9,C38
`Chr8:5390179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:5390306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B33,B7,C2
`Chr8:5390427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B11,B65
`Chr8:5390455`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B103,B11,B65
`Chr8:5390455`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B103,B11,B65
`Chr8:5390617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:5391579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782132.1

311 aa

156

311

dsrm

DND1_DSRM

dsrm

PF00035 dsrm 2-65 aa PF14709 DND1_DSRM 3-66 aa PF00035 dsrm 165-225 aa

XP_057782133.1

293 aa

146

293

dsrm

DND1_DSRM

dsrm

PF00035 dsrm 2-65 aa PF14709 DND1_DSRM 3-66 aa PF00035 dsrm 147-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782132.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	2	65	4.1e-23	82.4	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057782132.1`	Pfam	`PF14709`	DND1_DSRM	Domain	3	66	3e-08	34.6	double strand RNA binding domain from DEAD END PROTEIN 1
`XP_057782132.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	165	225	4.1e-23	82.4	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057782133.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	2	65	3.8e-23	82.5	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057782133.1`	Pfam	`PF14709`	DND1_DSRM	Domain	3	66	2.3e-08	34.9	double strand RNA binding domain from DEAD END PROTEIN 1
`XP_057782133.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	147	207	3.8e-23	82.5	Double-stranded RNA binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926149.1
ATGTACAAGTCGAAGCTGCAAGAGCTGTGCCAGAAACAGAAATTGGGGATGCCCAAATACACATGCATCCGAGATGGTGCTGATCACTGCCCTCAGTTTAAGGCCTCCGTCGTCGTCGCCGGCGCCGCCTTCCACAGCCCCTCCGCCGCCAACTCCTCCAAGCAAGCCTATAATCAAGTCGCTCAGCTTGCCTTCTCCCATTTCACTTCTCAAAAAAATGTTGGTAAGAAAGAAGTTGAGACCTCCAAATCGTCTGTCGA...

XM_057926150.1
ATGTACAAGTCGAAGCTGCAAGAGCTGTGCCAGAAACAGAAATTGGGGATGCCCAAATACACATGCATCCGAGATGGTGCTGATCACTGCCCTCAGTTTAAGGCCTCCGTCGTCGTCGCCGGCGCCGCCTTCCACAGCCCCTCCGCCGCCAACTCCTCCAAGCAAGCCTATAATCAAGTCGCTCAGCTTGCCTTCTCCCATTTCACTTCTCATTTGCATCAAGCATTCAAGAACAAACTTAGGATGTACGCTCAAAGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000304
ATGTACAAGTCGAAGCTGCAAGAGCTGTGCCAGAAACAGAAATTGGGGATGCCCAAATACACATGCATCCGAGATGGTGCTGATCACTGCCCTCAGTTTAAGGCCTCCGTCGTCGTCGCCGGCGCCGCCTTCCACAGCCCCTCCGCCGCCAACTCCTCCAAGCAAGCCTATAATCAAGTCGCTCAGCTTGCCTTCTCCCATTTCACTTCTCATTTGCATCAAGCATTCAAGAACAAACTTAGGATGTACGCTCAAAGAAA...

LOC131000304
ATGTACAAGTCGAAGCTGCAAGAGCTGTGCCAGAAACAGAAATTGGGGATGCCCAAATACACATGCATCCGAGATGGTGCTGATCACTGCCCTCAGTTTAAGGCCTCCGTCGTCGTCGCCGGCGCCGCCTTCCACAGCCCCTCCGCCGCCAACTCCTCCAAGCAAGCCTATAATCAAGTCGCTCAGCTTGCCTTCTCCCATTTCACTTCTCAAAAAAATGTTGGTAAGAAAGAAGTTGAGACCTCCAAATCGTCTGTCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782132.1
MYKSKLQELCQKQKLGMPKYTCIRDGADHCPQFKASVVVAGAAFHSPSAANSSKQAYNQVAQLAFSHFTSQKNVGKKEVETSKSSVDHNLHQAFKNKLRMYAQRKDLNQPEYKTEKEGDCFKATVSIAEESFTSNELCASAEEAQNSAAATALLALLTDAFHENYKALLHKVGTEEGFFPPVYKTISHGCDSFSSTVEVEGEVFEGAAAQSQKLAELSAAKAAYTALIERKLFEPRDEALEVAHRFESCDISYPQQKHES...

XP_057782133.1
MYKSKLQELCQKQKLGMPKYTCIRDGADHCPQFKASVVVAGAAFHSPSAANSSKQAYNQVAQLAFSHFTSHLHQAFKNKLRMYAQRKDLNQPEYKTEKEGDCFKATVSIAEESFTSNELCASAEEAQNSAAATALLALLTDAFHENYKALLHKVGTEEGFFPPVYKTISHGCDSFSSTVEVEGEVFEGAAAQSQKLAELSAAKAAYTALIERKLFEPRDEALEVAHRFESCDISYPQQKHESIGESEMKSSYLLCNRVRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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