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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000737`

染色体: Chr08 坐标: 5458776-5464912 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000737`
名称	SmilChr08G000737
描述	uncharacterized SmilChr08G000737
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5458776 - 5464912 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000315`
GeneID	`131000315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000315`
原始查询	`LOC131000315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832230]; symbol=AT5G21060; hit=AT5G21060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832230]; symbol=AT5G21060; hit=AT5G21060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G21060` (AT5G21060) Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832230] identity=65.4; qcov=0.984; evalue=3.62e-179; confidence=high
Rice	`Os12g0125400` - identity=61.6; qcov=0.982; evalue=6.08e-169; confidence=high
GO	GO:0004072 (aspartate kinase activity); GO:0004412 (homoserine dehydrogenase activity); GO:0009067 (aspartate family amino acid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00742 (Homoserine_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782144.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782144.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782144.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782144.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5459198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:5460253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,C24,C32,C68,C86
`Chr8:5460254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B136,B14,B88,C8
`Chr8:5460311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B9,C24
`Chr8:5460364`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B27
`Chr8:5460364`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B27
`Chr8:5461084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:5463661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:5463725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr8:5464426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C10,C46,D11
`Chr8:5464460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr8:5464492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782144.1

382 aa

191

382

Homoserine_dh

PF00742 Homoserine_dh 171-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782144.1`	Pfam	`PF00742`	Homoserine_dh	Domain	171	369	1.8e-48	165.4	Homoserine dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926161.1
TTCCAATTAAAGCGGAAAAAACAGAAGAAGAAAATAAAATTAATAAATAAATAAAGAAAAAGGTTCATCAATCATCAGTGTTCAGTCCAAGAACAGTTCAAACATCGGAATCGAGCTGCCACAGATTGCTCAAAAGAATTACAAAACCTCAATGCTCAAAGAATTTAGATAAAACAGGAGAGAGGAAATCAGCCAGAGTGATTGGGAAATGGTCAGCATTCCGTTGCTGCTGATGGGCTGCGGCGGCGTCGGCCGCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000315
ATGGTCAGCATTCCGTTGCTGCTGATGGGCTGCGGCGGCGTCGGCCGCCAGCTCCTCCACCACGTCATCTCTTGCCGCCCCCTCCATTCCCGACAGGGGTTGAGGTTAAGGGTGGTGGGAGTGTGTGATAGTAAATCTATGGTGGCGATACCGGATGTTTTGACCTCCGAATTCCGTGATGATTTTTTGCTGCAACTTTGCGAGATTAAGTCCAACGGCTCTTCTTTTCTCGATCTTACTAAAACTGGTGAATGTCAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782144.1
MVSIPLLLMGCGGVGRQLLHHVISCRPLHSRQGLRLRVVGVCDSKSMVAIPDVLTSEFRDDFLLQLCEIKSNGSSFLDLTKTGECQVYSGEEIGRKVIDVAASLRNSCGLALIDCSASSETIGLLSQVVNLDGCVVLANKKPLTSSLESYDKLVSHPRRIRHESTVGAGLPVISTINRMISSGDPIIRIIGSLSGTLGYVMSEVEGGRPFSQVVTAAKKLGFTEPDPRDDLSGMDVARKALILARLLGHRIELDSIKVES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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