当前解析结果
SmilChr08G000749| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000749 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000749 |
| 描述 | protein DGS1, mitochondrial |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5532119 - 5539096 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000328 |
|---|---|
| GeneID | 131000328 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000328 |
| 原始查询 | LOC131000328 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein DGS1, mitochondrial |
| 产物 | protein DGS1%2C mitochondrial |
| Arabidopsis | AT5G12290 (DGS1)dgd1 suppressor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831104] identity=57.1; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0377500- identity=54.8; qcov=0.739; evalue=1.53e-153; confidence=high |
| GO | GO:0005741 (mitochondrial outer membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08637 (NCA2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000328 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057782166.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057782166.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.40000 | XP_057782166.1 |
| 4 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057782166.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057782166.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5532468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr8:5534040 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:5536038 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:5536629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,C32,C51,C68 |
Chr8:5536701 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr8:5537289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,B57,C75 |
Chr8:5537634 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr8:5537658 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B67,C19,C48 |
Chr8:5537717 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:5538116 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,A3,C42 |
Chr8:5538122 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,C32,C51,C68 |
Chr8:5538320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782166.1PF08637
NCA2 321-595 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782166.1 |
Pfam | PF08637 |
NCA2 | Family | 321 | 595 | 5.2e-76 | 256.3 | ATP synthase regulation protein NCA2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。