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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000757`

染色体: Chr08 坐标: 5576357-5577642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000757`
名称	SmilChr08G000757
描述	zinc finger protein ZAT4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5576357 - 5577642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000337`
GeneID	`131000337`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000337`
原始查询	`LOC131000337`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT4-like
产物	zinc finger protein ZAT4-like
Arabidopsis	`AT4G35280` (DAZ2) C2H2-like zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829681] identity=30.1; qcov=0.607; evalue=1.39e-18; confidence=low
Rice	`Os02g0659100` - identity=24.6; qcov=0.878; evalue=2.66e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2); PF12874 (zf-met); PF13894 (zf-C2H2_4); PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000337

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782184.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782184.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782184.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782184.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5576593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C80
`Chr8:5576680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A14,B105,B124,C84
`Chr8:5576929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:5576965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:5576983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:5577159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782184.1

328 aa

164

328

zf-C2H2_6

zf-met

zf-C2H2_6

zf-C2H2

zf-C2H2_4

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 50-73 aa PF12874 zf-met 51-71 aa PF13912 zf-C2H2_6 104-126 aa PF00096 zf-C2H2 245-267 aa PF13894 zf-C2H2_4 245-267 aa PF13912 zf-C2H2_6 245-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782184.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	50	73	2.8e-24	85.2	C2H2-type zinc finger
`XP_057782184.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	51	71	5.1e-07	30.5	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057782184.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	104	126	2.8e-24	85.2	C2H2-type zinc finger
`XP_057782184.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	245	267	4e-08	34.0	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057782184.1`	Pfam	`PF13894`	zf-C2H2_4	Domain	245	267	9.4e-11	42.2	C2H2-type zinc finger
`XP_057782184.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	245	268	2.8e-24	85.2	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926201.1
CTCTTCTACCCAAAATTAATTAATTCTTCAAAAAATAAAAAAATAAAATATCTCCGATCCTTTTAAATTTAAAGATCTTGACGCATATCAACACATTCCTTATTTCTCTGCGCGTGCCTCTTTTTCCCACAATTCCCTCTCTTGATTGATTGAATTCCTAATTCCAAATTCCAAATTCCAAGCATGGAGCAGAAAGACGGCGATAATCCGGTGGGAGAAGACGAGGCGGGTGGATCGGAGAAGGGGAGATCAATTCCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000337
ATGGAGCAGAAAGACGGCGATAATCCGGTGGGAGAAGACGAGGCGGGTGGATCGGAGAAGGGGAGATCAATTCCGGTGATCAAGATCAGAATCCCAAAGAAGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGATCAGGAAGAAGAGGCGAGGAGCCATTACTGCAAGGAATGCAACAAGAGCTTCAACTCCGGCAAGGCGCTGGGCGGCCACATGAGCAGCGCCCACGTCCAAGCTAACAACTTGAAGAAGCAGATGAGCGCCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782184.1
MEQKDGDNPVGEDEAGGSEKGRSIPVIKIRIPKKAAAAAEEDQEEEARSHYCKECNKSFNSGKALGGHMSSAHVQANNLKKQMSASNSKRKSPSSSSSATAAACGICARVFQSRKSLFGHMRCHPDRLWRGMEPPPEMKINSSEDDEDDILNDHELGFFNLKGWPTSKRGRAPVSSSSSASTPLVAGFQLMKMLKDDDGDAKKPAAAAAEEEKELYMTAIEVLMSAKREQRSSVNSNSNSDSEKYKCSVCGRVFSTHQAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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