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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000760`

染色体: Chr08 坐标: 5606448-5610068 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000760`
名称	SmilChr08G000760
描述	phospholipase A1 PLIP2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5606448 - 5610068 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000340`
GeneID	`131000340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000340`
原始查询	`LOC131000340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1 PLIP2, chloroplastic
产物	phospholipase A1 PLIP2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G02660` (AT1G02660) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839544] identity=55; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0253900` (P0705D01.7-1) - identity=49.2; qcov=0.94; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008970 (glycerophospholipid phospholipase A1 activity)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057782190.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057782190.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782190.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782190.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782190.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5606853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C9
`Chr8:5606994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:5607005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:5607287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:5607298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:5607770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:5607787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:5607934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:5607965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:5607967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:5608012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C65
`Chr8:5608240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B24,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782190.1

711 aa

356

711

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 358-495 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782190.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	358	495	6.7e-28	98.1	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926207.1
GGAGTTTTTCTAGTTGCAGCCTGGCATTAAAAAATCATATATTTACAGAGGGAGAGAGAGAGAGGGGAGAGAGGGAGGCAAAGAGGAGAGAGAGGTTTTAAGAAGTTTGGTCGTCTGTTTTATTTTGTAGCTACTGAATAAAAAAGTAGTTCCAGAGGAAAAGAAATCACTCTCTCTAACCTGCTGAAAGAGGAATCAGAAATTCAAAGATTGTGGCTGACGTTATCATTCTCCGCCTCCCTCTACGTATCACCTATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000340
ATGGATGCTTTGTGGTTTAAGGCGGGGATCCACGCCATGGCGGCGGCGCCGATCGCCGCCGCCTCCGGAAATGGGGAGGTCCGCCTGAGCGATAGGCCGTCCGTCTCGACGGCGCAGCCGAAGAGCTCGCCGTGGGGTTTCACTTTCCGGCACCCCCTCAGATCTCTGTGGCCCGGCCCCGGCGGCAAAAACCGGTTCGAACCGGCCATCTCGGTCGACGACGCCGTTTTGGCTGAGGAGAGGGATGACGTCAGAGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782190.1
MDALWFKAGIHAMAAAPIAAASGNGEVRLSDRPSVSTAQPKSSPWGFTFRHPLRSLWPGPGGKNRFEPAISVDDAVLAEERDDVRESEEEGRNGNWVLKILHVRSLWKEEEKHGDLVEELGVKLEEDGKDCGGEREGCDVCDCDYDDEENIQFDRESFSKLLRKVPLAEARFYSQMSYLGSLAYSISQIKPGNLLRHHGLRFVTSSLEKKEQALRVEKEKISAEEAQQELKTATGAQDDECHGTESEDVGEAKANGIRPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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