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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004198`

染色体: Chr01 坐标: 60452877-60464940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004198`
名称	SmilChr01G004198
描述	CLIP-associated protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60452877 - 60464940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000342`
GeneID	`131000342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000342`
原始查询	`LOC131000342`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CLIP-associated protein
产物	CLIP-associated protein
Arabidopsis	`AT2G20190` (CLASP) CLIP-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816539] identity=73.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0617300` - identity=65.3; qcov=0.522; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0005881 (cytoplasmic microtubule); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF02985 (HEAT); PF12348 (CLASP_N); PF13513 (HEAT_EZ); PF21041 (XMAP215_CLASP_TOG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057782196.1`
2	Phragmoplast	Phragmoplast	0.80000	`XP_057782196.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782196.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057782196.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057782196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60453300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:60453349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:60454961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:60459074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B49,B51
`Chr1:60459120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:60459380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B12,B49,B51
`Chr1:60459540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:60459831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:60460182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:60460649`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C77
`Chr1:60460649`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C77
`Chr1:60460687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782196.1

1435 aa

718

1435

XMAP215_CLASP_TOG

HEAT_EZ

HEAT

CLASP_N

XMAP215_CLASP_TOG

PF21041 XMAP215_CLASP_TOG 11-213 aa PF13513 HEAT_EZ 132-185 aa PF02985 HEAT 160-187 aa PF12348 CLASP_N 284-500 aa PF12348 CLASP_N 795-986 aa PF21041 XMAP215_CLASP_TOG 1233-1412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782196.1`	Pfam	`PF21041`	XMAP215_CLASP_TOG	Repeat	11	213	5.4e-23	82.7	XMAP215/Dis1/CLASP, TOG domain
`XP_057782196.1`	Pfam	`PF13513`	HEAT_EZ	Repeat	132	185	1.3e-17	64.5	HEAT-like repeat
`XP_057782196.1`	Pfam	`PF02985`	HEAT	Repeat	160	187	5.7e-26	88.8	HEAT repeat
`XP_057782196.1`	Pfam	`PF12348`	CLASP_N	Repeat	284	500	8.5e-71	238.8	CLASP N terminal
`XP_057782196.1`	Pfam	`PF12348`	CLASP_N	Repeat	795	986	8.5e-71	238.8	CLASP N terminal
`XP_057782196.1`	Pfam	`PF21041`	XMAP215_CLASP_TOG	Repeat	1233	1412	5.4e-23	82.7	XMAP215/Dis1/CLASP, TOG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926213.1
ACCATGTCAAAATAATTTGACTTATTTTCCGACTTTCATTACACACATAATTTTATCCACCTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACACTTCCCCTTTCCTCACTCTCCAACTCCGAGCAGATCCGATCGTCCGTCGGCGAGATCGCTCCCTGCGAAATCACCGAACTGCCCCTACCGCCGCTGCAATGGAGGAGGCGCTGGAGTTGGCGCGTGCGAAGGACACAAAGGAGCGGATGGCGGGCGTCGAGCGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000342
ATGGAGGAGGCGCTGGAGTTGGCGCGTGCGAAGGACACAAAGGAGCGGATGGCGGGCGTCGAGCGCCTCCACCAACTCCTCGAAGCTTCTAGAAAGACGCTATCTCCGTCGGAGGTGACGTCACTCGTCGACGTCGGCCTAGATCTCTTGAAGGACAACAACTTCCGGGTGTCACAGGGCGGTTTGCAGGCGCTCGCCTCCGCCGCCGTGCTCTCCGGCGAGCACTTCAAGCTGCATTTCAATGCGCTTGTTCCGGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782196.1
MEEALELARAKDTKERMAGVERLHQLLEASRKTLSPSEVTSLVDVGLDLLKDNNFRVSQGGLQALASAAVLSGEHFKLHFNALVPAVVERLGDAKQPVRDAARRLLLTLMEVSSPTIIVERAGSYAWMHRSWRIREEFARTVTSAIGLFAATELPLQRAILPPILQMLNDPNPGVREAAISCIEEMFTQAGPQFLEELNRHHLPAPMLRDINARLEKIEPKIHSSDAIVSNYSSTETKPTMHNPKKSSPKAKNTSREISL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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