当前解析结果
SmilChr08G000768| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000768 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000768 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000768 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5674711 - 5677662 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000350 |
|---|---|
| GeneID | 131000350 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000350 |
| 原始查询 | LOC131000350 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000350 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057782203.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057782203.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057782203.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782203.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782203.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5675000 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B75,C24,C37,C82 |
Chr8:5675007 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,C19,D11 |
Chr8:5675016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 22 | A10,A9,B102,B123,B13,B133,B4,B42,B57,B64,B76,B96,C14,C16,C19,C23,C24,C29,C36,C40,C42,C52 |
Chr8:5675025 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr8:5675027 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C61,C82 |
Chr8:5675053 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B125,B88,C73 |
Chr8:5675053 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B88,C73 |
Chr8:5675079 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,C24,C82 |
Chr8:5675088 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C61,C82 |
Chr8:5675089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,C38 |
Chr8:5675098 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B113,B123,B27,B98,C43 |
Chr8:5675105 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B92 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。