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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000773`

染色体: Chr08 坐标: 5695574-5698253 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000773`
名称	SmilChr08G000773
描述	uncharacterized SmilChr08G000773
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5695574 - 5698253 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000355`
GeneID	`131000355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000355`
原始查询	`LOC131000355`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRFPV-1; symbol=OsRFPV-1; hit=Os01g0303600; species=rice; confidence=high
产物	OsRFPV-1; symbol=OsRFPV-1; hit=Os01g0303600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G02610` (AT1G02610) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837915] identity=47.4; qcov=0.933; evalue=1.11e-63; confidence=high
Rice	`Os01g0303600` (OsRFPV-1) - identity=54.7; qcov=0.759; evalue=1.24e-64; confidence=high
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF12428 (DUF3675); PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057782209.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057782209.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057782209.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782209.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5697547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B95
`Chr8:5697858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr8:5697871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B65,C21,C22,C36
`Chr8:5698028`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	167	A1,A10,A11,A13,A18,A20,A22,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B129,B131,B132,B133,B136,B138,B139,B140,B15,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B29,B30,B34,B36,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B62,B67,B69,B71,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B97,B98,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C30,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C8,C81,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:5698069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782209.1

224 aa

112

224

RINGv

DUF3675

PF12906 RINGv 24-71 aa PF12428 DUF3675 77-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782209.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	24	71	6.9e-15	55.6	RING-variant domain
`XP_057782209.1`	Pfam	`PF12428`	DUF3675	Family	77	178	5e-27	95.5	Protein of unknown function (DUF3675)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926226.1
GCGCGTCTACATTTTATTAAGTCGTAAAATCAATTTAATTTAAAATTAAAATCACATTAAGGGCAATATCGTAATTTTGGGTCTCAAAGGCTCCTTACATAAGAGACGAGCGAGTAACAGAAAAAACGAAATTTGGTAATAAATTTAGAGGGGAAAACAGAGAAAAAGGAGAAAGTGATGAGCGAAATCGTGTTATTGATAGATGATTTGAGATCATCATCGTCTTCTTCTGCGCCTTCCAATATTTGCAGAATCTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000355
ATGAGCGAAATCGTGTTATTGATAGATGATTTGAGATCATCATCGTCTTCTTCTGCGCCTTCCAATATTTGCAGAATCTGCCATGATGAAGAATTTGAGAGCTACAAAACTCTCGAGGCTCCTTGCGCTTGTTCTGGGACTGTAAAGTTTGCGCACAGAGATTGCGTACAGAGATGGTGCGATGAAAAGGGCAACACAACTTGTGAAATTTGCTTACAGAAATTTGAACCTGGTTACACATCTCCACCAAAGAAAATACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782209.1
MSEIVLLIDDLRSSSSSSAPSNICRICHDEEFESYKTLEAPCACSGTVKFAHRDCVQRWCDEKGNTTCEICLQKFEPGYTSPPKKIQLIDATVTIRGSLEVPRNDEQQLETEHFECDDAADRSASFCRTLALIFTALLLTRHLFGVVSGAGDYPFSLVTVLIAKASGILVPMYILIRILATLQSNIRHHYQNAHTDSNSDDDDDDEDDDEEDEERRHSSIETLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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